Evidence map›Paper›PMID 41168819›Full record

ArticleMolecular autism2025

Exome sequencing in severe non-syndromic specific learning and language disorders in a French cohort.

Eléonore Viora-Dupont, Julian Delanne, Aurore Garde, Sophie Nambot, Estelle Colin, Marie Bournez, Clémence Fauconnier-Fatus, Caroline Racine, Clément Simao De Souza, Céline Bernard and 22 more

Abstract read
In one paragraph

Article in Molecular autism, 2025. The graph could read no effect estimate from its abstract, so it casts no vote on the map. Cited by 1 paper.

0numbers the graph read from it
0cells of the map it votes in
1citing papers in PubMed
–field-weighted citation impact
1 · What the graph read from it

What it found

Each row is one number read from the abstract, on the scale the paper reported it, with its interval. Left of the dashed line favours the treatment, right favours the comparator. Under each row is the sentence it came from. New to these charts? A ten-minute tutorial.

The abstract states no effect estimate the extractor could read, or names no intervention and outcome on the map, so this paper lights no cell and moves no belief. It is still indexed, cited and linked below.

2 · The registry

The trial behind it

Trials whose registry record cites this paper, or whose number appears in the abstract. A trial that started after this paper was published is citing it as background, not reporting it.

Neither the registry nor the abstract names a trial number. If this is a trial report, that itself is worth knowing.

3 · Its place in the literature

Who cites it

1 citing paper in PubMed.

  1. Article
4 · The record

Corrections and comments

PubMed lists nothing against this paper. Absence here is not a guarantee, only a check that was made.

5 · Who and what money

Authors and funding

32 authors.

Eléonore Viora-DupontUniversité Bourgogne Europe, CHU Dijon Bourgogne, INSERM, CTM UMR1231, équipe GAD, FHU TRANSLAD, Centre de génétique, Centre de référence Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs, Dijon, France. eleonore.viora-dupont@chu-dijon.fr.
Julian DelanneUniversité Bourgogne Europe, CHU Dijon Bourgogne, INSERM, CTM UMR1231, équipe GAD, FHU TRANSLAD, Centre de génétique, Centre de référence Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs, Dijon, France.
Aurore GardeUniversité Bourgogne Europe, CHU Dijon Bourgogne, INSERM, CTM UMR1231, équipe GAD, FHU TRANSLAD, Centre de génétique, Centre de référence Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs, Dijon, France.
Sophie NambotUniversité Bourgogne Europe, CHU Dijon Bourgogne, INSERM, CTM UMR1231, équipe GAD, FHU TRANSLAD, Centre de génétique, Centre de référence Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs, Dijon, France.
Estelle ColinUniversité Bourgogne Europe, CHU Dijon Bourgogne, INSERM, CTM UMR1231, équipe GAD, FHU TRANSLAD, Centre de génétique, Centre de référence Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs, Dijon, France.
Marie BournezUniversité Bourgogne Europe, CHU Dijon Bourgogne, INSERM, CTM UMR1231, équipe GAD, FHU TRANSLAD, Centre de génétique, Centre de référence Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs, Dijon, France.
Clémence Fauconnier-FatusUniversité Bourgogne Europe, CHU Dijon Bourgogne, INSERM, CTM UMR1231, équipe GAD, FHU TRANSLAD, Centre de génétique, Centre de référence Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs, Dijon, France.
Caroline RacineUniversité Bourgogne Europe, CHU Dijon Bourgogne, INSERM, CTM UMR1231, équipe GAD, FHU TRANSLAD, Centre de génétique, Centre de référence Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs, Dijon, France.
Clément Simao De SouzaUniversité Bourgogne Europe, CHU Dijon Bourgogne, INSERM, CTM UMR1231, équipe GAD, FHU TRANSLAD, Centre de génétique, Centre de référence Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs, Dijon, France.
Céline BernardUniversité Bourgogne Europe, CHU Dijon Bourgogne, INSERM, CTM UMR1231, équipe GAD, FHU TRANSLAD, Centre de génétique, Centre de référence Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs, Dijon, France.
Agnès MaurerUniversité Bourgogne Europe, CHU Dijon Bourgogne, INSERM, CTM UMR1231, équipe GAD, FHU TRANSLAD, Centre de génétique, Centre de référence Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs, Dijon, France.
Aurélie EspitalierUniversité Bourgogne Europe, CHU Dijon Bourgogne, INSERM, CTM UMR1231, équipe GAD, FHU TRANSLAD, Centre de génétique, Centre de référence Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs, Dijon, France.
Christine BinquetCHU Dijon Bourgogne, INSERM, Université de Bourgogne, CIC 1432, Module Épidémiologie Clinique, Dijon, France.
Marion BouctotCHU Dijon Bourgogne, INSERM, Université de Bourgogne, CIC 1432, Module Épidémiologie Clinique, Dijon, France.
Marie-Laure HumbertCHU Dijon Bourgogne, INSERM, Université de Bourgogne, CIC 1432, Module Épidémiologie Clinique, Dijon, France.
Anne-Sophie BriffautCHU Dijon Bourgogne, INSERM, Université de Bourgogne, CIC 1432, Module Épidémiologie Clinique, Dijon, France.
Véronique DarmencyReference Center for Language and Learning Disorders, Dijon University Hospital, Dijon, France.
Patricia PlumetReference Center for Language and Learning Disorders, Dijon University Hospital, Dijon, France.
Audrey Cotinaud-RicouReference Center for Language and Learning Disorders, Dijon University Hospital, Dijon, France.
Noémie RelinUniversité Bourgogne Europe, CHU Dijon Bourgogne, INSERM, CTM UMR1231, équipe GAD, FHU TRANSLAD, Centre de génétique, Centre de référence Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs, Dijon, France.
Patrick CallierChromosomal and Molecular Genetics Laboratory, Dijon University Hospital, Dijon, France.
Anne-Laure Mosca-BoidronChromosomal and Molecular Genetics Laboratory, Dijon University Hospital, Dijon, France.
Nathalie MarleChromosomal and Molecular Genetics Laboratory, Dijon University Hospital, Dijon, France.
Frederic Tran Mau-ThemUniversité Bourgogne Europe, CHU Dijon Bourgogne, INSERM, CTM UMR1231, équipe GAD, FHU TRANSLAD, Laboratoire de Génomique Médicale, Dijon, France.
Anne-Sophie Denommé-PichonUniversité Bourgogne Europe, CHU Dijon Bourgogne, INSERM, CTM UMR1231, équipe GAD, FHU TRANSLAD, Laboratoire de Génomique Médicale, Dijon, France.
Hana SafraouUniversité Bourgogne Europe, CHU Dijon Bourgogne, INSERM, CTM UMR1231, équipe GAD, FHU TRANSLAD, Laboratoire de Génomique Médicale, Dijon, France.
Antonio VitobelloUniversité Bourgogne Europe, CHU Dijon Bourgogne, INSERM, CTM UMR1231, équipe GAD, FHU TRANSLAD, Laboratoire de Génomique Médicale, Dijon, France.
Christophe PhilippeUniversité Bourgogne Europe, CHU Dijon Bourgogne, INSERM, CTM UMR1231, équipe GAD, FHU TRANSLAD, Laboratoire de Génomique Médicale, Dijon, France.
Yannis DuffourdUniversité Bourgogne Europe, CHU Dijon Bourgogne, INSERM, CTM UMR1231, équipe GAD, FHU TRANSLAD, Laboratoire de Génomique Médicale, Dijon, France.
Ange-Line BruelUniversité Bourgogne Europe, CHU Dijon Bourgogne, INSERM, CTM UMR1231, équipe GAD, FHU TRANSLAD, Laboratoire de Génomique Médicale, Dijon, France.
Christel Thauvin-RobinetUniversité Bourgogne Europe, CHU Dijon Bourgogne, INSERM, CTM UMR1231, équipe GAD, FHU TRANSLAD, Centre de génétique, Centre de référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares, Dijon, France.
Laurence FaivreUniversité Bourgogne Europe, CHU Dijon Bourgogne, INSERM, CTM UMR1231, équipe GAD, FHU TRANSLAD, Centre de génétique, Centre de référence Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs, Dijon, France. laurence.faivre@chu-dijon.fr.

Funding

No grant is acknowledged in the PubMed record.

6 · The paper itself

Abstract

backgroundSpecific learning disorders (SLDs) affect approximately 5% of school-age children. In France, genetic investigations of complex non-syndromic SLD cases include chromosomal microarray analysis and fragile X syndrome testing. However, the examples of genes being described in intellectual disability or autism spectrum disorder and also reported in patients with complex and severe SLDs are multiplying. International efforts using exome sequencing have identified monogenic diseases that explain severe SLDs in some instances. The aim of our study was to investigate the value of exome sequencing in children with SLDs without intellectual disability and autism spectrum disorder.

methodsWe initiated a prospective study using exome sequencing in patients with well-documented, severe SLD.

resultsAnalysis of 82 patients revealed pathogenic/likely pathogenic variants in 11 (13.4%) patients (ADNP, BRAF, CREBBP, KCNN2, KIF1A, RERE, SCN8A, SET, SMARCC2 (x2), TRIO). In addition, 38 variants of uncertain significance in candidate genes for severe neurodevelopmental disorders (NDDs) or in genes of unknown significance that could contribute to the phenotype were identified in 30 patients. LIMITATIONS: The study of 82 patients does not provide sufficient statistical power to conclude that exome testing adds value over chromosomal microarray analysis, or to determine which patient profiles are more likely to benefit from genetic testing. Studies with larger patient numbers are needed to increase statistical power.

conclusionsThis study confirms the involvement of NDD genes in milder phenotypes and suggests the potential of exome sequencing for diagnosing severe SLDs. Further research on larger samples is required to determine which SLDs are most likely to benefit from pangenomic explorations and to clarify the implication of candidate variants.

Indexed as

ExomeExome SequencingLanguage DisordersLearning DisabilitiesAdolescentChildChild, PreschoolCohort StudiesFemaleFranceGenetic Predisposition to DiseaseHumansMaleMutationPhenotypeProspective StudiesDevelopmental language disordersExome sequencingNeurodevelopmental disordersSpecific learning disorders

Identifiers

PMID41168819
PMCPMC12574064

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