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ArticlePathogens (Basel, Switzerland)2025

First Detection of

Tayane B S Magalhães, Amanda de O Viana, Thiago B F Semedo, Juliane S Saldanha, Nicole A Dos Reis, Nathalia de A Pereira, Rachel V P de Barros, Hannah R Miranda, Gabriella C Almeida, Desyrée Y S R Ozaki and 15 more

Abstract read
PubMed Full text at PMC Publisher
In one paragraph

Article in Pathogens (Basel, Switzerland), 2025. The graph could read no effect estimate from its abstract, so it casts no vote on the map. Cited by 3 papers.

0numbers the graph read from it
0cells of the map it votes in
3citing papers in PubMed
–field-weighted citation impact
1 · What the graph read from it

What it found

Each row is one number read from the abstract, on the scale the paper reported it, with its interval. Left of the dashed line favours the treatment, right favours the comparator. Under each row is the sentence it came from. New to these charts? A ten-minute tutorial.

The abstract states no effect estimate the extractor could read, or names no intervention and outcome on the map, so this paper lights no cell and moves no belief. It is still indexed, cited and linked below.

2 · The registry

The trial behind it

Trials whose registry record cites this paper, or whose number appears in the abstract. A trial that started after this paper was published is citing it as background, not reporting it.

Neither the registry nor the abstract names a trial number. If this is a trial report, that itself is worth knowing.

3 · Its place in the literature

Who cites it

3 citing papers in PubMed.

  1. Molecular Characterization of HemotropicPathogens (Basel, Switzerland) · 2026
    Article
  2. Article
  3. Article
4 · The record

Corrections and comments

PubMed lists nothing against this paper. Absence here is not a guarantee, only a check that was made.

5 · Who and what money

Authors and funding

25 authors.

Tayane B S MagalhãesLaboratório de Virologia e Rickettsioses, Faculdade de Medicina Veterinária, Universidade Federal de Mato Grosso, Fernando Correa da Costa, 2367, Cuiabá 78060-900, Brazil.
Amanda de O VianaLaboratório de Virologia Clínica e Molecular, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil.ORCID 0000-0002-5586-7491
Thiago B F SemedoLaboratório de Virologia e Rickettsioses, Faculdade de Medicina Veterinária, Universidade Federal de Mato Grosso, Fernando Correa da Costa, 2367, Cuiabá 78060-900, Brazil.
Juliane S SaldanhaLaboratório de Virologia e Rickettsioses, Faculdade de Medicina Veterinária, Universidade Federal de Mato Grosso, Fernando Correa da Costa, 2367, Cuiabá 78060-900, Brazil.
Nicole A Dos ReisLaboratório de Pesquisa em Vírus Emergentes, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil.
Nathalia de A PereiraLaboratório de Virologia e Rickettsioses, Faculdade de Medicina Veterinária, Universidade Federal de Mato Grosso, Fernando Correa da Costa, 2367, Cuiabá 78060-900, Brazil.ORCID 0000-0002-4045-9073
Rachel V P de BarrosLaboratório de Virologia e Rickettsioses, Faculdade de Medicina Veterinária, Universidade Federal de Mato Grosso, Fernando Correa da Costa, 2367, Cuiabá 78060-900, Brazil.ORCID 0000-0003-3224-810X
Hannah R MirandaLaboratório de Virologia e Rickettsioses, Faculdade de Medicina Veterinária, Universidade Federal de Mato Grosso, Fernando Correa da Costa, 2367, Cuiabá 78060-900, Brazil.
Gabriella C AlmeidaLaboratório de Virologia e Rickettsioses, Faculdade de Medicina Veterinária, Universidade Federal de Mato Grosso, Fernando Correa da Costa, 2367, Cuiabá 78060-900, Brazil.
Desyrée Y S R OzakiLaboratório de Pesquisa em Vírus Emergentes, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil.
Giovana S CaleiroLaboratório de Pesquisa em Vírus Emergentes, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil.
Gustavo O FennerLaboratório de Pesquisa em Vírus Emergentes, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil.ORCID 0000-0002-3073-3470
Fernanda P VizuLaboratório de Pesquisa em Vírus Emergentes, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil.
Theo KraiserLaboratório de Pesquisa em Vírus Emergentes, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil.
Thais P CarvalhoLaboratório de Pesquisa em Vírus Emergentes, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil.
Luciano M ThomazelliLaboratório de Virologia Clínica e Molecular, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil.ORCID 0000-0002-9157-6122
Erick G DorlassLaboratório de Virologia Clínica e Molecular, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil.
Clarice W ArnsDepartamento de Genética, Evolução, Microbiologia e Imunologia, Instituto de Biociências, Universidade Estadual de Campinas, Campinas 13083-862, Brazil.
Helena L FerreiraFaculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos, Universidade de São Paulo, Pirassununga 13635-900, Brazil.ORCID 0000-0002-3261-3712
Erika Hingst-ZaherMuseu Biológico, Instituto Butantan, São Paulo 05585-000, Brazil.
Rogério Vieira RossiLaboratorio de Mastozoologia, Instituto de Biociencias, Universidade Federal de Mato Grosso, Cuiabá 78060-900, Brazil.
Guilherme S T GarbinoMuseu de Zoologia João Moojen, Departamento de Biologia Animal, Universidade Federal de Viçosa, Viçosa 36570-900, Brazil.ORCID 0000-0003-1701-5930
Edison L DurigonLaboratório de Virologia Clínica e Molecular, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil.ORCID 0000-0003-4898-6553
Jansen de AraujoLaboratório de Pesquisa em Vírus Emergentes, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo 05508-000, Brazil.ORCID 0000-0002-7250-3024
Daniel M de AguiarLaboratório de Virologia e Rickettsioses, Faculdade de Medicina Veterinária, Universidade Federal de Mato Grosso, Fernando Correa da Costa, 2367, Cuiabá 78060-900, Brazil.ORCID 0000-0001-8631-522X

Funding

Fundação para a Ciência e Tecnologia 2022.10212.BDNational Council for Scientific and Technological Development 403761/2020-4 and 400172/2022-4
6 · The paper itself

Abstract

Coronaviruses (CoV) infect a wide variety of hosts, causing epidemics in humans, birds, and mammals over the years. Bats (order Chiroptera) are one of the natural hosts of the Coronaviridae family. They represent 40% of the total number of mammal species in the Pantanal, a biodiversity hotspot in South America. Given the recent SARS-CoV-2 pandemic, we investigated the presence of CoV in bats captured in the Brazilian Pantanal. Oral and rectal swabs collected in 2021 from 419 bats were analyzed using Pancoronavirus-nested PCR targeting the RNA-dependent RNA-polymerase (RdRp) gene. Orthocoronavirinae was detected in 16.7% (70/419) of the bats; nine samples were sequenced, confirming that

Indexed as

AlphacoronavirusChiropteraCoronavirus InfectionsAnimalsBrazilDisease ReservoirsHumansPhylogenySARS-CoV-2WetlandsChiropteramolecular detectionOrthocoronavirusPancoronavirus RT-PCRwestern Brazil

Identifiers

PMID39861019
PMCPMC11768564

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