Evidence map›Paper›PMID 38327295›Full record

ArticleBiodiversity data journal2023

The InBIO barcoding initiative database: DNA barcodes of Iberian Trichoptera, documenting biodiversity for freshwater biomonitoring in a Mediterranean hotspot.

Joana Pauperio, Luis Martin Gonzalez, Jesus Martinez, Marcos A González, Filipa Ms Martins, Joana Veríssimo, Pamela Puppo, Joana Pinto, Cátia Chaves, Catarina J Pinho and 8 more

Abstract read
In one paragraph

Article in Biodiversity data journal, 2023. The graph could read no effect estimate from its abstract, so it casts no vote on the map. Cited by 2 papers.

0numbers the graph read from it
0cells of the map it votes in
2citing papers in PubMed
–field-weighted citation impact
1 · What the graph read from it

What it found

Each row is one number read from the abstract, on the scale the paper reported it, with its interval. Left of the dashed line favours the treatment, right favours the comparator. Under each row is the sentence it came from. New to these charts? A ten-minute tutorial.

The abstract states no effect estimate the extractor could read, or names no intervention and outcome on the map, so this paper lights no cell and moves no belief. It is still indexed, cited and linked below.

2 · The registry

The trial behind it

Trials whose registry record cites this paper, or whose number appears in the abstract. A trial that started after this paper was published is citing it as background, not reporting it.

Neither the registry nor the abstract names a trial number. If this is a trial report, that itself is worth knowing.

3 · Its place in the literature

Who cites it

2 citing papers in PubMed.

  1. Article
  2. Article
4 · The record

Corrections and comments

PubMed lists nothing against this paper. Absence here is not a guarantee, only a check that was made.

5 · Who and what money

Authors and funding

18 authors.

Joana PauperioBIOPOLIS Program in Genomics, Biodiversity and Land Planning, CIBIO, Campus de Vairão, 4485-661 Vairão, Vila do Conde, Portugal BIOPOLIS Program in Genomics, Biodiversity and Land Planning, CIBIO, Campus de Vairão, 4485-661 Vairão Vila do Conde Portugal.ORCID https://orcid.org/0000-0003-2569-0768
Luis Martin GonzalezDepartamento de Zoología, Genética y Antropología Física, Facultad de Biología. Universidad de Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, Spain Departamento de Zoología, Genética y Antropología Física, Facultad de Biología. Universidad de Santiago de Compostela Santiago de Compostela Spain.
Jesus MartinezDepartamento de Zoología, Genética y Antropología Física, Facultad de Biología. Universidad de Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, Spain Departamento de Zoología, Genética y Antropología Física, Facultad de Biología. Universidad de Santiago de Compostela Santiago de Compostela Spain.
Marcos A GonzálezDepartamento de Zoología, Genética y Antropología Física, Facultad de Biología. Universidad de Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, Spain Departamento de Zoología, Genética y Antropología Física, Facultad de Biología. Universidad de Santiago de Compostela Santiago de Compostela Spain.
Filipa Ms MartinsCIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Campus de Vairão, Universidade do Porto, 4485-661 Vairão, Vila do Conde, Portugal CIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Campus de Vairão, Universidade do Porto, 4485-661 Vairão Vila do Conde Portugal.ORCID https://orcid.org/0000-0003-4191-5031
Joana VeríssimoCIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Campus de Vairão, Universidade do Porto, 4485-661 Vairão, Vila do Conde, Portugal CIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Campus de Vairão, Universidade do Porto, 4485-661 Vairão Vila do Conde Portugal.
Pamela PuppoMarshall University, Department of Biological Sciences, Huntington, United States of America Marshall University, Department of Biological Sciences Huntington United States of America.ORCID https://orcid.org/0000-0002-5038-0238
Joana PintoCIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Campus de Vairão, Universidade do Porto, 4485-661 Vairão, Vila do Conde, Portugal CIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Campus de Vairão, Universidade do Porto, 4485-661 Vairão Vila do Conde Portugal.
Cátia ChavesCIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Campus de Vairão, Universidade do Porto, 4485-661 Vairão, Vila do Conde, Portugal CIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Campus de Vairão, Universidade do Porto, 4485-661 Vairão Vila do Conde Portugal.ORCID https://orcid.org/0000-0002-0979-5896
Catarina J PinhoCIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Campus de Vairão, Universidade do Porto, 4485-661 Vairão, Vila do Conde, Portugal CIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Campus de Vairão, Universidade do Porto, 4485-661 Vairão Vila do Conde Portugal.ORCID https://orcid.org/0000-0003-0353-7885
José Manuel Grosso-SilvaMuseu de História Natural e da Ciência da Universidade do Porto, Porto, Portugal Museu de História Natural e da Ciência da Universidade do Porto Porto Portugal.ORCID https://orcid.org/0000-0002-1094-0771
Lorenzo QuagliettaCIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Instituto Superior de Agronomia, Universidade de Lisboa, Lisboa, Portugal CIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Instituto Superior de Agronomia, Universidade de Lisboa Lisboa Portugal.ORCID https://orcid.org/0000-0002-9703-0171
Teresa Luísa L SilvaCIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Campus de Vairão, Universidade do Porto, 4485-661 Vairão, Vila do Conde, Portugal CIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Campus de Vairão, Universidade do Porto, 4485-661 Vairão Vila do Conde Portugal.ORCID https://orcid.org/0000-0002-6868-7035
Pedro SousaCIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Campus de Vairão, Universidade do Porto, 4485-661 Vairão, Vila do Conde, Portugal CIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Campus de Vairão, Universidade do Porto, 4485-661 Vairão Vila do Conde Portugal.ORCID https://orcid.org/0000-0002-5859-9656
Paulo Celio AlvesCIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Campus de Vairão, Universidade do Porto, 4485-661 Vairão, Vila do Conde, Portugal CIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Campus de Vairão, Universidade do Porto, 4485-661 Vairão Vila do Conde Portugal.
Nuno FonsecaCIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Campus de Vairão, Universidade do Porto, 4485-661 Vairão, Vila do Conde, Portugal CIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Campus de Vairão, Universidade do Porto, 4485-661 Vairão Vila do Conde Portugal.ORCID https://orcid.org/0000-0003-4832-578X
Pedro BejaBIOPOLIS Program in Genomics, Biodiversity and Land Planning, CIBIO, Campus de Vairão, 4485-661 Vairão, Vila do Conde, Portugal BIOPOLIS Program in Genomics, Biodiversity and Land Planning, CIBIO, Campus de Vairão, 4485-661 Vairão Vila do Conde Portugal.ORCID https://orcid.org/0000-0001-8164-0760
Sónia FerreiraCIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Campus de Vairão, Universidade do Porto, 4485-661 Vairão, Vila do Conde, Portugal CIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Campus de Vairão, Universidade do Porto, 4485-661 Vairão Vila do Conde Portugal.ORCID https://orcid.org/0000-0002-6884-3966

Funding

No grant is acknowledged in the PubMed record.

6 · The paper itself

Abstract

Background: The Trichoptera are an important component of freshwater ecosystems. In the Iberian Peninsula, 380 taxa of caddisflies are known, with nearly 1/3 of the total species being endemic in the region. A reference collection of morphologically identified Trichoptera specimens, representing 142 Iberian taxa, was constructed. The InBIO Barcoding Initiative (IBI) Trichoptera 01 dataset contains records of 438 sequenced specimens. The species of this dataset correspond to about 37% of Iberian Trichoptera species diversity. Specimens were collected between 1975 and 2018 and are deposited in the IBI collection at the CIBIO (Research Center in Biodiversity and Genetic Resources, Portugal) or in the collection Marcos A. González at the University of Santiago de Compostela (Spain). New information: Twenty-nine species, from nine different families, were new additions to the Barcode of Life Data System (BOLD). A success identification rate of over 80% was achieved when comparing morphological identifications and DNA barcodes for the species analysed. This encouraging step advances incorporation of informed Environmental DNA tools in biomonitoring schemes, given the shortcomings of morphological identifications of larvae and adult Caddisflies in such studies. DNA barcoding was not successful in identifying species in six Trichoptera genera:

Indexed as

continental Portugalcontinental Spaincytochrome c oxidase subunit I (COI)DNA barcodeoccurrence recordsspecies distributionsTrichoptera

Identifiers

PMID38327295
PMCPMC10848855

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Registered trials

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