ArticleViruses2023
A Multiplex Nanopore Sequencing Approach for the Detection of Multiple Arboviral Species.
Open access · goldAbstract read
In one paragraph
Article in Viruses, 2023. The graph could read no effect estimate from its abstract, so it casts no vote on the map. Cited by 3 papers.
0numbers the graph read from it
0cells of the map it votes in
3citing papers in PubMed
0.9field-weighted citation impact, top 23% of its field
What it found
Each row is one number read from the abstract, on the scale the paper reported it, with its interval. Left of the dashed line favours the treatment, right favours the comparator. Under each row is the sentence it came from. New to these charts? A ten-minute tutorial.
The abstract states no effect estimate the extractor could read, or names no intervention and outcome on the map, so this paper lights no cell and moves no belief. It is still indexed, cited and linked below.
The trial behind it
Trials whose registry record cites this paper, or whose number appears in the abstract. A trial that started after this paper was published is citing it as background, not reporting it.
Neither the registry nor the abstract names a trial number. If this is a trial report, that itself is worth knowing.
Who cites it
3 citing papers in PubMed, 3 citations in OpenAlex.
- Enhanced blood parasite species identification using V4-V9 18S rDNA barcoding by universal primers on a nanopore platform.Scientific reports · 2025Article
- Development of a semicomprehensive detection method for paramyxoviruses and its validation using Indonesian bats.Scientific reports · 2025Article
- Article
Corrections and comments
PubMed lists nothing against this paper. Absence here is not a guarantee, only a check that was made.
Authors and funding
55 authors at 14 institutions in 4 countries.
Joilson XavierInstituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte 31270-901, Brazil.ORCID 0000-0003-3916-2018
Vagner FonsecaOrganização Pan-Americana da Saúde, Organização Mundial da Saúde, Brasília 70800-400, Brazil.ORCID 0000-0001-5521-6448
Talita AdelinoLaboratorio Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais, Fundação Ezequiel Dias, Belo Horizonte 30510-010, Brazil.
Felipe C M IaniLaboratorio Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais, Fundação Ezequiel Dias, Belo Horizonte 30510-010, Brazil.ORCID 0000-0002-3629-8529
Glauco C PereiraLaboratorio Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais, Fundação Ezequiel Dias, Belo Horizonte 30510-010, Brazil.
Myrian M DuarteLaboratorio Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais, Fundação Ezequiel Dias, Belo Horizonte 30510-010, Brazil.
Mauricio LimaInstituto Rene Rachou, Fundação Oswaldo Cruz, Belo Horizonte 30190-002, Brazil.ORCID 0000-0002-0830-3909
Emerson CastroInstituto Rene Rachou, Fundação Oswaldo Cruz, Belo Horizonte 30190-002, Brazil.ORCID 0000-0002-3210-7342
Carla Oliveiralnstituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro 21040-900, Brazil.ORCID 0000-0002-0829-036X
Hegger FritschInstituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte 31270-901, Brazil.ORCID 0000-0002-1997-5786
Natalia GuimarãesLaboratorio Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais, Fundação Ezequiel Dias, Belo Horizonte 30510-010, Brazil.
Ludmila O LamounierLaboratorio Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais, Fundação Ezequiel Dias, Belo Horizonte 30510-010, Brazil.
Fernanda Khouri BarretoInstituto Multidisciplinar em Saúde, Universidade Federal da Bahia, Vitória da Conquista 45029-094, Brazil.ORCID 0000-0002-0088-9036
Camilo M M Braga de OliveiraLaboratório Central de Saúde Pública do Acre, Rio Branco 69900-604, Brazil.
Crhistinne C Maymone GonçalvesSecretaria de Saúde do estado do Mato Grosso do Sul, Campo Grande 79031-350, Brazil.ORCID 0000-0001-6953-4965
Danielle Malta LimaFaculty of the Graduate Program in Biotechnology (Renorbio), Universidade de Fortaleza, Fortaleza 60811-905, Brazil.
Elaine C de OliveiraLaboratorio Central de Saúde Pública do Mato Grosso, Cuiabá 78060-628, Brazil.
Gislene G de Castro LichsLaboratorio Central de Saúde Pública do Mato Grosso do Sul, Campo Grande 79074-460, Brazil.
Iago GomesLaboratório Central de Saúde Pública do Rio Grande do Norte, Natal 59037-170, Brazil.
Janaina MazaroSecretaria Estadual de Saúde do estado do Acre, Rio Branco 69900-064, Brazil.
Janete T N RodriguesLaboratório Central de Saúde Pública do Acre, Rio Branco 69900-604, Brazil.
Jayra AbrantesLaboratório Central de Saúde Pública do Rio Grande do Norte, Natal 59037-170, Brazil.
Jeová K B ColaresFaculty of the Graduate Program in Biotechnology (Renorbio), Universidade de Fortaleza, Fortaleza 60811-905, Brazil.ORCID 0000-0003-1367-6272
Kleber G LuzDepartment of Infectious Diseases, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal 59078-900, Brazil.
Luana Barbosa da SilvaLaboratorio Central de Saúde Pública do Mato Grosso, Cuiabá 78060-628, Brazil.
Luiz DemarchiLaboratorio Central de Saúde Pública do Mato Grosso do Sul, Campo Grande 79074-460, Brazil.
Magaly C B CâmaraLaboratório Central de Saúde Pública do Rio Grande do Norte, Natal 59037-170, Brazil.
Marina C S Umaki ZardinLaboratorio Central de Saúde Pública do Mato Grosso do Sul, Campo Grande 79074-460, Brazil.
Rafaela Sabatini Mello PinheiroLaboratório de Citogenética, Universidade Federal do Acre, Rio Branco 69920-900, Brazil.ORCID 0000-0003-1856-4501
Rutilene Barbosa SouzaLaboratório Central de Saúde Pública do Acre, Rio Branco 69900-604, Brazil.
Simone K HaddadFundação Hemocentro de Ribeirão Preto, Ribeirão Preto 14051-140, Brazil.
Stephanni Figueiredo da SilvaLaboratorio Central de Saúde Pública do Mato Grosso, Cuiabá 78060-628, Brazil.
Svetoslav N SlavovFundação Hemocentro de Ribeirão Preto, Ribeirão Preto 14051-140, Brazil.ORCID 0000-0003-0805-6140
Themis RochaLaboratório Central de Saúde Pública do Rio Grande do Norte, Natal 59037-170, Brazil.
Noelia MorelDepartamento de Laboratorios de Salud Pública, Ministerio de Salud Pública, Montevideo 11200, Uruguay.
Hector ChiparelliDepartamento de Laboratorios de Salud Pública, Ministerio de Salud Pública, Montevideo 11200, Uruguay.ORCID 0000-0002-8713-1067
Analía BurgueñoDepartamento de Laboratorios de Salud Pública, Ministerio de Salud Pública, Montevideo 11200, Uruguay.
Victoria BórmidaDepartamento de Laboratorios de Salud Pública, Ministerio de Salud Pública, Montevideo 11200, Uruguay.
María N CortinasDepartamento de Laboratorios de Salud Pública, Ministerio de Salud Pública, Montevideo 11200, Uruguay.
Rosario S MartínDepartamento de Laboratorios de Salud Pública, Ministerio de Salud Pública, Montevideo 11200, Uruguay.
Allan C PereiraLaboratório de Fronteira Tabatinga, Tabatinga 69640-000, Brazil.
Marcelo F Dos SantosLaboratório de Fronteira Tabatinga, Tabatinga 69640-000, Brazil.
Walter André JúniorLaboratório de Fronteira Tabatinga, Tabatinga 69640-000, Brazil.
Jairo Mendez RicoPan American Health Organization, Washington, DC 20037, USA.
Leticia FrancoPan American Health Organization, Washington, DC 20037, USA.
Alexander RosewellOrganização Pan-Americana da Saúde, Organização Mundial da Saúde, Brasília 70800-400, Brazil.
Rodrigo F do Carmo SaidOrganização Pan-Americana da Saúde, Organização Mundial da Saúde, Brasília 70800-400, Brazil.
Carlos F C de AlbuquerqueOrganização Pan-Americana da Saúde, Organização Mundial da Saúde, Brasília 70800-400, Brazil.ORCID 0000-0003-0581-5535
Ethel L Noia MacielSecretaria de Vigilância em Saúde e Ambiente, Ministério da Saúde, Brasília 70058-900, Brazil.
Marília Santini de OliveiraCoordenação Geral dos Laboratórios de Saúde Pública, Ministério da Saúde, Brasília 70058-900, Brazil.
Rivaldo Venâncio da CunhaFundação Oswaldo Cruz, Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos, Rio de Janeiro 21040-090, Brazil.
Livia C Vinhal FrutuosoCoordenação Geral das Arboviroses, Ministério da Saúde, Brasília 70058-900, Brazil.
Ana M B de Filippislnstituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro 21040-900, Brazil.
Marta GiovanettiInstituto Rene Rachou, Fundação Oswaldo Cruz, Belo Horizonte 30190-002, Brazil.ORCID 0000-0002-5849-7326
Luiz Carlos Junior AlcantaraInstituto Rene Rachou, Fundação Oswaldo Cruz, Belo Horizonte 30190-002, Brazil.ORCID 0000-0002-6769-9931
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais · BRFundação Oswaldo Cruz · BRMinisterio de Salud Pública · UYSecretaria da Saúde · BRPan American Health Organization (Brasil) · BRMinistério da Saúde · BRFundação Hemopa · BRUniversidade de Fortaleza · BRUniversidade Federal de Minas Gerais · BRWorld Health Organization Regional Office for the Americas · USUniversidade Federal da Bahia · BRUniversidade Federal do Acre · BRUniversidade Federal do Rio Grande do Norte · BRUniversità Campus Bio-Medico · IT
Funding
University of Washington Arboviral Research Network (UWARN)U01AI151698 · NIAID · UNIVERSITY OF WASHINGTON · PI Michael Gale, PETER MACGARR RABINOWITZ · 2020 to 2026
$13.3MNIAID NIH HHS U01 AI151698
Abstract
The emergence and continued geographic expansion of arboviruses and the growing number of infected people have highlighted the need to develop and improve multiplex methods for rapid and specific detection of pathogens. Sequencing technologies are promising tools that can help in the laboratory diagnosis of conditions that share common symptoms, such as pathologies caused by emerging arboviruses. In this study, we integrated nanopore sequencing and the advantages of reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) to develop a multiplex RT-PCR protocol for the detection of Chikungunya virus (CHIKV) and several orthoflaviviruses (such as dengue (
Indexed as
ArbovirusesChikungunya virusDengueNanopore SequencingZika VirusZika Virus InfectionHumansMultiplex Polymerase Chain ReactionarbovirusChikungunya virusgenotypingnanopore sequencingorthoflaviviruses
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