ArticleScience advances2023
Genomic epidemiology unveils the dynamics and spatial corridor behind the Yellow Fever virus outbreak in Southern Brazil.
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What it found
Each row is one number read from the abstract, on the scale the paper reported it, with its interval. Left of the dashed line favours the treatment, right favours the comparator. Under each row is the sentence it came from. New to these charts? A ten-minute tutorial.
The abstract states no effect estimate the extractor could read, or names no intervention and outcome on the map, so this paper lights no cell and moves no belief. It is still indexed, cited and linked below.
The trial behind it
Trials whose registry record cites this paper, or whose number appears in the abstract. A trial that started after this paper was published is citing it as background, not reporting it.
Neither the registry nor the abstract names a trial number. If this is a trial report, that itself is worth knowing.
Who cites it
30 citing papers in PubMed.
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- A generalized lineage nomenclature for viral genomic epidemiology.Nature microbiology · 2026Article
- Arbovirus co-circulation and epidemiological convergence in a changing climate: challenges for surveillance, diagnosis and public health preparedness.Brazilian journal of microbiology : [publication of the Brazilian Society for Microbiology] · 2026Review
- Dynamics and ecology of a multistage expansion of Oropouche virus in Brazil.Nature ecology & evolution · 2026Article
- Article
- Entomo-virological investigation during the epizootic outbreak of sylvatic yellow fever in Rio Grande do Sul, Brazil, between 2021 and 2022Memorias do Instituto Oswaldo Cruz · 2026Article
- Yellow Fever, an Arboviral Disease with Public Health Impacts: General Aspects and the Use of the One Health Approach in the Context of This Zoonosis.Infection and drug resistance · 2026Review
- Article
- Phylogenetic insights into the transmission dynamics of arthropod-borne viruses.Nature reviews. Genetics · 2026Review
- Surveillance Service of Yellow Fever in Non-Human Primates in the Federal District, Brazil, 2008-2022.Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical · 2026Article
- Reemergence of yellow fever virus in forest and periurban settings in Brazil.Communications medicine · 2025Article
- Reemergence of Yellow Fever, Magdalena Valley, Colombia, 2024-2025.Emerging infectious diseases · 2025Review
- Risk factors for emerging, re-emerging, and newly recognized arboviruses and zoonotic viruses in Brazilian amazon.PLoS neglected tropical diseases · 2025Review
- Yellow Fever Virus in Aedes albopictus Mosquitoes from Urban Green Area, São Paulo State, Brazil.Emerging infectious diseases · 2025Article
- Assessing Urban Yellow Fever Transmission Risk:Viruses · 2025Article
- Re-emergence of Yellow Fever Virus in Brazil: Evidence from Forest and peri-urban Settings.medRxiv : the preprint server for health sciences · 2025Article
- Climate, inter-serotype competition and arboviral interactions shape dengue dynamics in Thailand.Communications biology · 2025Article
- Yellow Fever Virus in Mosquitoes from Rainforest Bordering Manaus, Brazil, 2022.Emerging infectious diseases · 2025Article
- Travel-associated international spread of Oropouche virus beyond the Amazon.Journal of travel medicine · 2025Article
- ExploitingPathogens (Basel, Switzerland) · 2025Review
Corrections and comments
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Authors and funding
94 authors.
Marta GiovanettiLaboratório de Flavivírus, Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, Brazil.ORCID 0000-0002-5849-7326
Francesco PinottiDepartment of Zoology, University of Oxford, Oxford, OX3 7BN, UK.ORCID 0000-0003-1953-2106
Camila ZanlucaLaboratório de Virologia Molecular, Instituto Carlos Chagas/Fiocruz-PR, Curitiba, Paraná, Brazil.ORCID 0000-0001-7350-9105
Vagner FonsecaOrganização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde, Brasília, Distrito Federal, Brazil.ORCID 0000-0001-5521-6448
Taishi NakaseNuffield Department of Medicine, University of Oxford, Oxford, OX3 7BN, UK.ORCID 0000-0002-3078-098X
Andrea C KoishiLaboratório de Virologia Molecular, Instituto Carlos Chagas/Fiocruz-PR, Curitiba, Paraná, Brazil.ORCID 0000-0002-3542-1353
Marcel TschaLaboratório de Virologia Molecular, Instituto Carlos Chagas/Fiocruz-PR, Curitiba, Paraná, Brazil.
Guilherme SoaresLaboratório de Virologia Molecular, Instituto Carlos Chagas/Fiocruz-PR, Curitiba, Paraná, Brazil.
Gisiane Gruber DorlLaboratório de Virologia Molecular, Instituto Carlos Chagas/Fiocruz-PR, Curitiba, Paraná, Brazil.ORCID 0000-0002-7113-5098
Antônio Ernesto M L MarquesLaboratório de Virologia Molecular, Instituto Carlos Chagas/Fiocruz-PR, Curitiba, Paraná, Brazil.ORCID 0000-0002-9161-5929
Renato SousaLaboratório de Patologia Veterinária, Hospital Veterinário UFPR, PR Brazil.ORCID 0000-0002-6491-9302
Talita Emile Ribeiro AdelinoLaboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais, Fundação Ezequiel Dias, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil.ORCID 0000-0002-1471-0084
Joilson XavierInstituto Rene Rachou, Fundação Oswaldo Cruz, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil.ORCID 0000-0003-3916-2018
Carla de OliveiraLaboratório de Flavivírus, Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, Brazil.ORCID 0000-0002-0829-036X
Sandro PatrocaEvandro Chagas Institute, Para, Brazil.
Natalia Rocha GuimaraesLaboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais, Fundação Ezequiel Dias, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil.ORCID 0000-0002-9859-5895
Hegger FritschInstituto Rene Rachou, Fundação Oswaldo Cruz, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil.ORCID 0000-0002-1997-5786
Maria Angélica Mares-GuiaLaboratório de Flavivírus, Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, Brazil.ORCID 0000-0002-2380-3821
Flavia LevyLaboratório de Flavivírus, Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, Brazil.
Pedro Henrique PassosCoordenação Geral das Arboviroses, Secretaria de Vigilância em Saúde/Ministério da Saúde (CGARB/SVS-MS), Brasília, Distrito Federal, Brazil.ORCID 0000-0001-7903-4518
Vinicius Leme da SilvaLaboratório Central de Saúde Pública Dr Giovanni Cysneiros, Goiânia, Goiás, Brazil.
Luiz Augusto PereiraLaboratório Central de Saúde Pública Dr Giovanni Cysneiros, Goiânia, Goiás, Brazil.ORCID 0000-0002-2670-8512
Ana Flávia MendonçaLaboratório Central de Saúde Pública Dr Giovanni Cysneiros, Goiânia, Goiás, Brazil.ORCID 0000-0002-5480-0949
Isabel Luana de MacêdoVeterinary Pathology Laboratory, Campus Darcy Ribeiro, University of Brasília, Brasília, DF 70636- 200, Brazil.
Davi Emanuel Ribeiro de SousaVeterinary Pathology Laboratory, Campus Darcy Ribeiro, University of Brasília, Brasília, DF 70636- 200, Brazil.ORCID 0000-0003-1237-0693
Gabriela Rodrigues de Toledo CostaEnvironmental Health Surveillance, Directorate of the Federal District (DIVAL), DF 70790-060, Brazil.
Marcio Botelho de CastroVeterinary Pathology Laboratory, Campus Darcy Ribeiro, University of Brasília, Brasília, DF 70636- 200, Brazil.
Miguel de Souza AndradeBaculovirus Laboratory, Department of Cell Biology, Institute of Biological Sciences, University of Brasilia, Brasília 70910-900, DF, Brazil.
Filipe Vieira Santos de AbreuInsect Behavior Laboratory, Federal Institute of Northern Minas Gerais, Salinas 39560-000, MG, Brazil.
Fabrício Souza CamposInstitute of Basic Health Sciences, Federal University of Rio Grande do Sul, Porto Alegre 90035-003, RS, Brazil.ORCID 0000-0002-5948-472X
Felipe Campos de Melo IaniLaboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais, Fundação Ezequiel Dias, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil.
Maira Alves PereiraLaboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais, Fundação Ezequiel Dias, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil.
Karina Ribeiro Leite Jardim CavalcanteCoordenação Geral das Arboviroses, Secretaria de Vigilância em Saúde/Ministério da Saúde (CGARB/SVS-MS), Brasília, Distrito Federal, Brazil.ORCID 0009-0000-3964-9606
Andre Ricardo Ribas de FreitasFaculdade de Medicina São Leopoldo Mandic, Campinas, SP, Brazil.ORCID 0000-0003-0291-7771
Carlos Frederico Campelo de AlbuquerqueOrganização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde, Brasília, Distrito Federal, Brazil.ORCID 0000-0003-0581-5535
Eduardo Marques MacárioSuperintendência de Vigilância em Saúde - SES - Santa Catarina, South Brazil.
Marlei Pickler Debiasi Dos AnjosLaboratorio central de Saude Publica de Santa Catarina, Superintendência de Vigilância em Saúde - SES - Santa Catarina, South Brazil.ORCID 0000-0001-7005-8601
Rosane Campanher RamosLaboratório Central de Saúde Pública do Estado do Rio Grande do Sul, Superintendência de Vigilância em Saúde - SES - Santa Catarina, South Brazil.ORCID 0000-0002-9714-9252
Aline Alves Scarpellini CamposSecretaria Estadual de Saúde do Rio Grande do Sul, Centro Estadual de Vigilância em Saúde, Porto Alegre, RS, Brazil.ORCID 0000-0002-1731-3527
Adriano PinterDepartamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal, Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Universidade de São Paulo, São Paulo, 05508-000, Brazil.ORCID 0000-0003-4596-3268
Marcia ChameOswaldo Cruz Foundation, Biodiversity, Wildlife Health Institutional Platform (PIBSS/Fiocruz), Rio de Janeiro, Brazil.ORCID 0000-0003-4680-500X
Livia AbdallaOswaldo Cruz Foundation, Biodiversity, Wildlife Health Institutional Platform (PIBSS/Fiocruz), Rio de Janeiro, Brazil.ORCID 0000-0001-5847-8814
Irina Nastassja RiedigerLaboratório Central de Saúde Pública do Estado do Paraná (Lacen-PR), Curitiba, Paraná, Brazil.ORCID 0000-0002-4804-0429
Sérvio Pontes RibeiroLaboratory of Ecology of Diseases & Forests, NUPEB/ICEB, Federal University of Ouro Preto, Minas Gerais, Brazil.
Ana I BentoPandemic Prevention Initiative, The Rockefeller Foundation, Washington DC, USA.
Tulio de OliveiraSchool for Data Science and Computational Thinking, Faculty of Science and Faculty of Medicine and Health Sciences, Stellenbosch University, South Africa.ORCID 0000-0002-3027-5254
Carla FreitasSecretaria de Vigilância em Saúde, SVS, Brazilian Ministry of Health, Brasilia, Federal District, Brazil.
Noely Fabiana Oliveira de MouraOswaldo Cruz Foundation, Fiocruz, Brasilia, Federal District, Brazil.
Allison FabriLaboratório de Flavivírus, Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, Brazil.
Cintia Damasceno Dos Santos RodriguesLaboratório de Flavivírus, Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, Brazil.
Carolina Cardoso Dos SantosLaboratório de Flavivírus, Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, Brazil.
Marco Antonio Barreto de AlmeidaSecretaria Estadual de Saúde do Rio Grande do Sul, Centro Estadual de Vigilância em Saúde, Porto Alegre, RS, Brazil.
Edmilson Dos SantosSecretaria Estadual de Saúde do Rio Grande do Sul, Centro Estadual de Vigilância em Saúde, Porto Alegre, RS, Brazil.ORCID 0000-0002-7468-5853
Jader CardosoSecretaria Estadual de Saúde do Rio Grande do Sul, Centro Estadual de Vigilância em Saúde, Porto Alegre, RS, Brazil.ORCID 0000-0002-1214-1084
Douglas Adriano AugustoPlataforma Institucional Biodiversidade e Saúde Silvestre - Centro de Informação em Saúde Silvestre (CISS) - Fiocruz/RJ, Avenida Brasil, 4365. Manguinhos - Rio de Janeiro - RJ Cep: 21.040-360.ORCID 0000-0001-5719-6786
Eduardo KrempserPlataforma Institucional Biodiversidade e Saúde Silvestre - Centro de Informação em Saúde Silvestre (CISS) - Fiocruz/RJ, Avenida Brasil, 4365. Manguinhos - Rio de Janeiro - RJ Cep: 21.040-360.ORCID 0000-0002-4652-442X
Luís Filipe MucciSecretaria da Saúde (São Paulo - Estado), Av Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, 188 - Cerqueira César, São Paulo - SP, 05403-000, Brazil.ORCID 0000-0002-7766-7597
Renata Rispoli GattiSecretaria de Estado da Saude de Santa Catarina, R. Esteves Júnior, 160 - Centro, Florianópolis - SC, 88015-130, Brazil.ORCID 0000-0002-9997-9030
Sabrina Fernandes CardosoSecretaria de Estado da Saude de Santa Catarina, R. Esteves Júnior, 160 - Centro, Florianópolis - SC, 88015-130, Brazil.ORCID 0000-0003-4484-6764
João Augusto Brancher FuckDiretoria de Vigilância Epidemiológica da Secretaria de Estado da Saúde de Santa Catarina, R. Esteves Júnior, 160 - Centro, Florianópolis - SC, 88015-130, Brazil.
Maria Goretti David LopesSecretaria de Estado da Saúde do Paraná, Brazil, R. Piquiri, 170 - Rebouças, Curitiba - PR, 80230-140.
Ivana Lucia BelmonteSecretaria de Estado da Saúde do Paraná, Brazil, R. Piquiri, 170 - Rebouças, Curitiba - PR, 80230-140.
Gabriela Mayoral Pedroso da SilvaSecretaria de Estado da Saúde do Paraná, Brazil, R. Piquiri, 170 - Rebouças, Curitiba - PR, 80230-140.ORCID 0009-0003-3876-8269
Maiane Regina Ferreira SoaresSecretaria de Estado da Saúde do Paraná, Brazil, R. Piquiri, 170 - Rebouças, Curitiba - PR, 80230-140.
Marilia de Melo Santos de CastilhosSecretaria de Estado da Saúde do Paraná, Brazil, R. Piquiri, 170 - Rebouças, Curitiba - PR, 80230-140.
Joseana Cardoso de Souza E SilvaSecretaria de Estado da Saúde do Paraná, Brazil, R. Piquiri, 170 - Rebouças, Curitiba - PR, 80230-140.ORCID 0009-0005-8681-6725
Alceu Bisetto JuniorSecretaria de Estado da Saúde do Paraná, Brazil, R. Piquiri, 170 - Rebouças, Curitiba - PR, 80230-140.
Emanuelle Gemin PouzatoSecretaria de Estado da Saúde do Paraná, Brazil, R. Piquiri, 170 - Rebouças, Curitiba - PR, 80230-140.
Laurina Setsuko TanabeSecretaria de Estado da Saúde do Paraná, Brazil, R. Piquiri, 170 - Rebouças, Curitiba - PR, 80230-140.ORCID 0000-0001-8825-3368
Daniele Akemi AritaSecretaria de Estado da Saúde do Paraná, Brazil, R. Piquiri, 170 - Rebouças, Curitiba - PR, 80230-140.ORCID 0000-0003-1102-9063
Ricardo MatsuoSecretaria de Estado da Saúde do Paraná, Brazil, R. Piquiri, 170 - Rebouças, Curitiba - PR, 80230-140.
Josiane Dos Santos RaymundoSecretaria de Estado da Saúde do Paraná, Brazil, R. Piquiri, 170 - Rebouças, Curitiba - PR, 80230-140.
Paula Cristina Linder SilvaSecretaria de Estado da Saúde do Paraná, Brazil, R. Piquiri, 170 - Rebouças, Curitiba - PR, 80230-140.ORCID 0000-0002-1341-0944
Ana Santana Araújo Ferreira SilvaSecretaria de Estado da Saúde do Paraná, Brazil, R. Piquiri, 170 - Rebouças, Curitiba - PR, 80230-140.ORCID 0009-0004-4800-8113
Sandra SamilaSecretaria de Estado da Saúde do Paraná, Brazil, R. Piquiri, 170 - Rebouças, Curitiba - PR, 80230-140.ORCID 0000-0001-7185-4538
Glauco CarvalhoLaboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais, Fundação Ezequiel Dias, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil.ORCID 0000-0003-1651-7066
Rodrigo StabeliOrganização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde, Brasília, Distrito Federal, Brazil.ORCID 0000-0002-0476-920X
Wildo NavegantesOrganização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde, Brasília, Distrito Federal, Brazil.
Luciano Andrade MoreiraMosquitos Vetores: Endossimbiontes e Interação Patógeno-Vetor, Instituto René Rachou-Fiocruz, Belo Horizonte 30190-002, MG, Brazil.ORCID 0000-0002-9240-3506
Alvaro Gil A FerreiraMosquitos Vetores: Endossimbiontes e Interação Patógeno-Vetor, Instituto René Rachou-Fiocruz, Belo Horizonte 30190-002, MG, Brazil.ORCID 0000-0002-6299-0391
Guilherme Garcia PinheiroInstituto Rene Rachou, Fundação Oswaldo Cruz, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil.ORCID 0000-0001-7242-3385
Bruno Tardelli Diniz NunesEvandro Chagas Institute, Para, Brazil.ORCID 0000-0002-0793-9665
Daniele Barbosa de Almeida MedeirosEvandro Chagas Institute, Para, Brazil.ORCID 0000-0002-3939-0611
Ana Cecília Ribeiro CruzEvandro Chagas Institute, Para, Brazil.
Rivaldo Venâncio da CunhaFundação Oswaldo Cruz, Bio-Manguinhos, Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil.
Wes Van VoorhisCenter for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases (CERID), University of Washington, Seattle, WA, USA.ORCID 0000-0001-6141-2015
Ana Maria Bispo de FilippisLaboratório de Flavivírus, Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, Brazil.
Maria AlmironPan American Health Organization/World Health Organization, Washington, DC, USA.
Edward C HolmesMarie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity, School of Life and Environmental Sciences and School of Medical Sciences, University of Sydney, Sydney, NSW, Australia.ORCID 0000-0001-9596-3552
Daniel Garkauskas RamosCoordenação Geral das Arboviroses, Secretaria de Vigilância em Saúde/Ministério da Saúde (CGARB/SVS-MS), Brasília, Distrito Federal, Brazil.ORCID 0000-0002-7404-2209
Alessandro RomanoCoordenação Geral das Arboviroses, Secretaria de Vigilância em Saúde/Ministério da Saúde (CGARB/SVS-MS), Brasília, Distrito Federal, Brazil.ORCID 0000-0002-5501-7796
José LourençoBioISI (Biosystems and Integrative Sciences Institute), Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Campo Grande, 1749-016 Lisboa Portugal.ORCID 0000-0002-9318-2581
Luiz Carlos Junior AlcantaraLaboratório de Flavivírus, Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, Brazil.ORCID 0000-0002-6769-9931
Claudia Nunes Duarte Dos SantosLaboratório de Virologia Molecular, Instituto Carlos Chagas/Fiocruz-PR, Curitiba, Paraná, Brazil.ORCID 0000-0001-8707-6638
Funding
University of Washington Arboviral Research Network (UWARN)U01AI151698 · NIAID · UNIVERSITY OF WASHINGTON · PI Michael Gale, PETER MACGARR RABINOWITZ · 2020 to 2026
$13.3MNIAID NIH HHS U01 AI151698World Health Organization 001
Abstract
Despite the considerable morbidity and mortality of yellow fever virus (YFV) infections in Brazil, our understanding of disease outbreaks is hampered by limited viral genomic data. Here, through a combination of phylogenetic and epidemiological models, we reconstructed the recent transmission history of YFV within different epidemic seasons in Brazil. A suitability index based on the highly domesticated
Indexed as
Yellow FeverYellow fever virusBrazilDisease OutbreaksGenomicsHumansPhylogeny
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