Evidence map›Paper›PMID 36344512›Full record

ArticleNature communications2022

Connecting multiple microenvironment proteomes uncovers the biology in head and neck cancer.

Ariane F Busso-Lopes, Leandro X Neves, Guilherme A Câmara, Daniela C Granato, Marco Antônio M Pretti, Henry Heberle, Fábio M S Patroni, Jamile Sá, Sami Yokoo, César Rivera and 23 more

Open access · goldAbstract read
In one paragraph

Article in Nature communications, 2022. The graph could read no effect estimate from its abstract, so it casts no vote on the map. Cited by 11 papers.

0numbers the graph read from it
0cells of the map it votes in
11citing papers in PubMed
4.8field-weighted citation impact, top 3% of its field
1 · What the graph read from it

What it found

Each row is one number read from the abstract, on the scale the paper reported it, with its interval. Left of the dashed line favours the treatment, right favours the comparator. Under each row is the sentence it came from. New to these charts? A ten-minute tutorial.

The abstract states no effect estimate the extractor could read, or names no intervention and outcome on the map, so this paper lights no cell and moves no belief. It is still indexed, cited and linked below.

2 · The registry

The trial behind it

Trials whose registry record cites this paper, or whose number appears in the abstract. A trial that started after this paper was published is citing it as background, not reporting it.

Neither the registry nor the abstract names a trial number. If this is a trial report, that itself is worth knowing.

3 · Its place in the literature

Who cites it

11 citing papers in PubMed, 25 citations in OpenAlex.

  1. Review
  2. Review
  3. Article
  4. Article
  5. Article
  6. Article
  7. Observational
  8. Article
  9. Article
  10. Article
  11. Article
4 · The record

Corrections and comments

PubMed lists nothing against this paper. Absence here is not a guarantee, only a check that was made.

5 · Who and what money

Authors and funding

33 authors at 9 institutions in 2 countries.

Ariane F Busso-LopesLaboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil.ORCID 0000-0003-2280-1848
Leandro X NevesLaboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil.ORCID 0000-0002-6074-1025
Guilherme A CâmaraLaboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil.
Daniela C GranatoLaboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil.
Marco Antônio M PrettiLaboratório de Bioinformática e Biologia Computacional, Divisão de Pesquisa Experimental e Translacional, Instituto Nacional do Câncer - INCA, Rio de Janeiro, RJ, 20231-050, Brazil.ORCID 0000-0002-9511-294X
Henry HeberleInstituto de Ciências Matemáticas e de Computação, Universidade de São Paulo - USP, São Carlos, SP, 13566-590, Brazil.ORCID 0000-0003-1964-268X
Fábio M S PatroniCentro de Biologia Molecular e Engenharia Genética - CBMEG, Universidade Estadual de Campinas - UNICAMP, Campinas, SP, 13083-887, Brazil.ORCID 0000-0003-0221-8380
Jamile SáLaboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil.ORCID 0000-0002-5807-4403
Sami YokooLaboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil.ORCID 0000-0003-4658-9319
César RiveraLaboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil.ORCID 0000-0002-5491-4233
Romênia R DominguesLaboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil.
Ana Gabriela C NormandoLaboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil.
Tatiane De RossiLaboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil.
Barbara P MelloDepartamento de Radiologia e Oncologia, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo - USP, São Paulo, SP, 01246-903, Brazil.
Nayane A L GaldinoCentro Internacional de Pesquisa - CIPE, A.C. Camargo Cancer Center, São Paulo, SP, 01508-010, Brazil.
Bianca A PaulettiLaboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil.
Pammela A LacerdaDepartamento de Clínica Médica, Faculdade de Medicina de Jundiaí - FMJ, Jundiaí, SP, 13202-550, Brazil.
André Afonso N RodriguesDepartamento de Cirurgia de Cabeça e Pescoço, Faculdade de Medicina de Jundiaí - FMJ, Jundiaí, SP, 13202-550, Brazil.
André Luis M CasarimDepartamento de Cirurgia de Cabeça e Pescoço, Faculdade de Medicina de Jundiaí - FMJ, Jundiaí, SP, 13202-550, Brazil.ORCID 0000-0001-5708-8937
Reydson A de Lima-SouzaDepartamento de Diagnóstico Oral, Faculdade de Odontologia de Piracicaba, Universidade Estadual de Campinas - UNICAMP, Piracicaba, SP, 13414-903, Brazil.
Ingrid I DamasDepartamento de Patologia, Faculdade de Ciências Médicas, Universidade Estadual de Campinas - UNICAMP, Campinas, SP, 13083-887, Brazil.
Fernanda V MarianoDepartamento de Patologia, Faculdade de Ciências Médicas, Universidade Estadual de Campinas - UNICAMP, Campinas, SP, 13083-887, Brazil.
Kenneth J GollobCentro Internacional de Pesquisa - CIPE, A.C. Camargo Cancer Center, São Paulo, SP, 01508-010, Brazil.
Tiago S MedinaCentro Internacional de Pesquisa - CIPE, A.C. Camargo Cancer Center, São Paulo, SP, 01508-010, Brazil.ORCID 0000-0001-8674-8842
Nilva K CervigneDepartamento de Clínica Médica, Faculdade de Medicina de Jundiaí - FMJ, Jundiaí, SP, 13202-550, Brazil.
Ana Carolina Prado-RibeiroDepartamento de Diagnóstico Oral, Faculdade de Odontologia de Piracicaba, Universidade Estadual de Campinas - UNICAMP, Piracicaba, SP, 13414-903, Brazil.
Thaís Bianca BrandãoInstituto do Câncer do Estado de São Paulo - ICESP, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo - USP, São Paulo, SP, 01246-000, Brazil.
Luisa L VillaDepartamento de Radiologia e Oncologia, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo - USP, São Paulo, SP, 01246-903, Brazil.
Miyuki UnoInstituto do Câncer do Estado de São Paulo - ICESP, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo - USP, São Paulo, SP, 01246-000, Brazil.
Mariana BoroniLaboratório de Bioinformática e Biologia Computacional, Divisão de Pesquisa Experimental e Translacional, Instituto Nacional do Câncer - INCA, Rio de Janeiro, RJ, 20231-050, Brazil.
Luiz Paulo KowalskiDepartamento de Cirurgia de Cabeça e Pescoço e Otorrinolaringologia, A.C. Camargo Cancer Center, São Paulo, SP, 01509-900, Brazil.ORCID 0000-0002-0481-156X
Wilfredo Alejandro González-ArriagadaFacultad de Odontología, Patología Oral y Maxilofacial, Universidad de Los Andes, Santiago, Chile.ORCID 0000-0002-0563-4948
Adriana F Paes LemeLaboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil. adriana.paesleme@lnbio.cnpem.br.ORCID 0000-0001-7959-147X
Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol · BRUniversidade de São Paulo · BRUniversidade Estadual de Campinas (UNICAMP) · BRFaculdade de Medicina de Jundiaí · BRAC Camargo Hospital · BRInstituto Nacional de Câncer - INCA · BRHospital Israelita Albert Einstein · BRUniversidad de Los Andes, Chile · CLUniversity of Talca · CL

Funding

No grant is acknowledged in the PubMed record.

6 · The paper itself

Abstract

The poor prognosis of head and neck cancer (HNC) is associated with metastasis within the lymph nodes (LNs). Herein, the proteome of 140 multisite samples from a 59-HNC patient cohort, including primary and matched LN-negative or -positive tissues, saliva, and blood cells, reveals insights into the biology and potential metastasis biomarkers that may assist in clinical decision-making. Protein profiles are strictly associated with immune modulation across datasets, and this provides the basis for investigating immune markers associated with metastasis. The proteome of LN metastatic cells recapitulates the proteome of the primary tumor sites. Conversely, the LN microenvironment proteome highlights the candidate prognostic markers. By integrating prioritized peptide, protein, and transcript levels with machine learning models, we identify nodal metastasis signatures in blood and saliva. We present a proteomic characterization wiring multiple sites in HNC, thus providing a promising basis for understanding tumoral biology and identifying metastasis-associated signatures.

Indexed as

Head and Neck NeoplasmsProteomeHumansLymphatic MetastasisLymph NodesProteomicsTumor MicroenvironmentProteome

Identifiers

PMID36344512
PMCPMC9640649
OpenAlexW4308773808

What OpenQuestion holds

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LicenceCC BY
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Registered trials

None linked

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