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ArticleFrontiers in immunology2022

Metabolic Reprogramming in SARS-CoV-2 Infection Impacts the Outcome of COVID-19 Patients.

Laura E Martínez-Gómez, Isabel Ibarra-González, Cynthia Fernández-Lainez, Teresa Tusie, Hortensia Moreno-Macías, Carlos Martinez-Armenta, Guadalupe Elizabeth Jimenez-Gutierrez, Paola Vázquez-Cárdenas, Patricia Vidal-Vázquez, Juan P Ramírez-Hinojosa and 27 more

Open access · goldAbstract readMulticenter Study
In one paragraph

Article in Frontiers in immunology, 2022. The graph could read no effect estimate from its abstract, so it casts no vote on the map. Cited by 24 papers.

0numbers the graph read from it
0cells of the map it votes in
24citing papers in PubMed
4.3field-weighted citation impact, top 4% of its field
1 · What the graph read from it

What it found

Each row is one number read from the abstract, on the scale the paper reported it, with its interval. Left of the dashed line favours the treatment, right favours the comparator. Under each row is the sentence it came from. New to these charts? A ten-minute tutorial.

The abstract states no effect estimate the extractor could read, or names no intervention and outcome on the map, so this paper lights no cell and moves no belief. It is still indexed, cited and linked below.

2 · The registry

The trial behind it

Trials whose registry record cites this paper, or whose number appears in the abstract. A trial that started after this paper was published is citing it as background, not reporting it.

Neither the registry nor the abstract names a trial number. If this is a trial report, that itself is worth knowing.

3 · Its place in the literature

Who cites it

24 citing papers in PubMed, 50 citations in OpenAlex.

  1. Host metabolic responses to SARS-CoV-2 and influenza viruses: parallels and contrasts.Metabolomics : Official journal of the Metabolomic Society · 2026
    Review
  2. Article
  3. Observational
  4. Article
  5. SARS-CoV2 variants differentially impact on the plasma metabolome.Metabolomics : Official journal of the Metabolomic Society · 2025
    Article
  6. Review
  7. Article
  8. Article
  9. Article
  10. Article
  11. Article
  12. Article
  13. Article
  14. Article
  15. Review
  16. Review
  17. Article
  18. Article
  19. Article
  20. Review
4 · The record

Corrections and comments

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5 · Who and what money

Authors and funding

37 authors at 13 institutions in 1 country.

Laura E Martínez-GómezLaboratorio de Gerociencias, Laboratorio Facilitador, Laboratorio de Medicina Genómica, Dirección General, Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico.
Isabel Ibarra-GonzálezUnidad de Genética de la Nutrición, Instituto de Investigaciones Biomédicas, Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), Ciudad de México, Mexico.
Cynthia Fernández-LainezLaboratorio de Errores Innatos del Metabolismo y Tamiz, Instituto Nacional de Pediatría, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico.
Teresa TusieUnidad de Biología Molecular y Medicina Genómica, Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán, Instituto de Investigaciones Biomédicas UNAM, Ciudad de México, Mexico.
Hortensia Moreno-MacíasUnidad de Biología Molecular y Medicina Genómica, Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán, Instituto de Investigaciones Biomédicas UNAM, Ciudad de México, Mexico.
Carlos Martinez-ArmentaPosgrado en Biología Experimental, Dirección de Ciencias Biológicas y de la Salud (DCBS), Universidad Autónoma Metropolitana Iztapalapa, Ciudad de México, Mexico.
Guadalupe Elizabeth Jimenez-GutierrezLaboratorio de Gerociencias, Laboratorio Facilitador, Laboratorio de Medicina Genómica, Dirección General, Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico.
Paola Vázquez-CárdenasCentro de Innovación Médica Aplicada, Subdirección de Epidemiología e Infectología, Hospital General Dr. Manuel Gea González, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico.
Patricia Vidal-VázquezCentro de Innovación Médica Aplicada, Subdirección de Epidemiología e Infectología, Hospital General Dr. Manuel Gea González, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico.
Juan P Ramírez-HinojosaCentro de Innovación Médica Aplicada, Subdirección de Epidemiología e Infectología, Hospital General Dr. Manuel Gea González, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico.
Ana P Rodríguez-ZuluetaCentro de Innovación Médica Aplicada, Subdirección de Epidemiología e Infectología, Hospital General Dr. Manuel Gea González, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico.
Gilberto Vargas-AlarcónDepartamentos de Biología Molecular, Inmunología, Endocrinologia y Unidad de Cuidados Intensivos, Instituto Nacional de Cardiología Ignacio Chavez, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico.
Gustavo Rojas-VelascoDepartamentos de Biología Molecular, Inmunología, Endocrinologia y Unidad de Cuidados Intensivos, Instituto Nacional de Cardiología Ignacio Chavez, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico.
Fausto Sánchez-MuñozDepartamentos de Biología Molecular, Inmunología, Endocrinologia y Unidad de Cuidados Intensivos, Instituto Nacional de Cardiología Ignacio Chavez, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico.
Rosalinda Posadas-SanchezDepartamentos de Biología Molecular, Inmunología, Endocrinologia y Unidad de Cuidados Intensivos, Instituto Nacional de Cardiología Ignacio Chavez, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico.
Felipe de J Martínez-RuizNuevo Hospital General Delegación Regional Sur de la Ciudad de México, Instituto de Seguridad y Servicios Sociales para los Trabajadores del Estado (ISSSTE), Ciudad de México, Mexico.
Dulce M Zayago-AngelesNuevo Hospital General Delegación Regional Sur de la Ciudad de México, Instituto de Seguridad y Servicios Sociales para los Trabajadores del Estado (ISSSTE), Ciudad de México, Mexico.
Mariana L MorenoNuevo Hospital General Delegación Regional Sur de la Ciudad de México, Instituto de Seguridad y Servicios Sociales para los Trabajadores del Estado (ISSSTE), Ciudad de México, Mexico.
Edith Barajas-GaliciaHospital Central Norte Petróleos Mexicanos (PEMEX), Estado de México, Mexico City, Mexico.
Gerardo Lopez-CisnerosHospital Central Norte Petróleos Mexicanos (PEMEX), Estado de México, Mexico City, Mexico.
Nadia C Gonzalez-FernándezHospital Central Norte Petróleos Mexicanos (PEMEX), Estado de México, Mexico City, Mexico.
Silvestre Ortega-PeñaLaboratorio de Gerociencias, Laboratorio Facilitador, Laboratorio de Medicina Genómica, Dirección General, Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico.
Brígida Herrera-LópezLaboratorio de Gerociencias, Laboratorio Facilitador, Laboratorio de Medicina Genómica, Dirección General, Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico.
Jessel Olea-TorresLaboratorio de Gerociencias, Laboratorio Facilitador, Laboratorio de Medicina Genómica, Dirección General, Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico.
Manuel Juárez-AriasUnidad de Investigación y Desarrollo en Alimentos, Tecnológico Nacional de México/Instituto Tecnológico (IT) Veracruz, Veracruz, Mexico.
Maritza Rosas-VásquezUnidad de Investigación y Desarrollo en Alimentos, Tecnológico Nacional de México/Instituto Tecnológico (IT) Veracruz, Veracruz, Mexico.
Sara Aileen Cabrera-NietoPosgrado en Ciencias Médicas, Facultad de Ciencias de la Salud, Universidad Anáhuac, Ciudad de México, Mexico.
Jonathan J MagañaLaboratorio de Gerociencias, Laboratorio Facilitador, Laboratorio de Medicina Genómica, Dirección General, Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico.
María Del Carmen Camacho-ReaDepartamento de Nutrición Animal, Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico.
Carlos Suarez-AhedoLaboratorio de Gerociencias, Laboratorio Facilitador, Laboratorio de Medicina Genómica, Dirección General, Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico.
Irma Coronado-ZarcoInstituto Nacional de Perinatología Isidro Espinosa de los Reyes, Ciudad de México, Mexico.
M Y Valdespino-VázquezInstituto Nacional de Perinatología Isidro Espinosa de los Reyes, Ciudad de México, Mexico.
Gabriela Angélica Martínez-NavaLaboratorio de Gerociencias, Laboratorio Facilitador, Laboratorio de Medicina Genómica, Dirección General, Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico.
Carlos PinedaLaboratorio de Gerociencias, Laboratorio Facilitador, Laboratorio de Medicina Genómica, Dirección General, Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico.
Marcela Vela-AmievaLaboratorio de Errores Innatos del Metabolismo y Tamiz, Instituto Nacional de Pediatría, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico.
Alberto López-ReyesLaboratorio de Gerociencias, Laboratorio Facilitador, Laboratorio de Medicina Genómica, Dirección General, Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico.
Mex-Gen-COVID Initiative Group
Secretaria de Salud · MXInstituto Nacional de Rehabilitación · MXHospital General Dr. Manuel Gea Gonzalez · MXInstitute for Social Security and Services for State Workers · MXPemex (Mexico) · MXInstituto Nacional de Cardiología · MXInstituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán · MXInstituto Nacional de Perinatología · MXTecnológico Nacional de México · MXUniversidad Autónoma Metropolitana · MXInstituto Nacional de Pediatria · MXUniversidad Anáhuac · MXUniversidad Nacional Autónoma de México · MX

Funding

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6 · The paper itself

Abstract

Severe acute respiratory syndrome-coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection triggers inflammatory clinical stages that affect the outcome of patients with coronavirus disease 2019 (COVID-19). Disease severity may be associated with a metabolic imbalance related to amino acids, lipids, and energy-generating pathways. The aim of this study was to characterize the profile of amino acids and acylcarnitines in COVID-19 patients. A multicenter, cross-sectional study was carried out. A total of 453 individuals were classified by disease severity. Levels of 11 amino acids, 31 acylcarnitines, and succinylacetone in serum samples were analyzed by electrospray ionization-triple quadrupole tandem mass spectrometry. Different clusters were observed in partial least squares discriminant analysis, with phenylalanine, alanine, citrulline, proline, and succinylacetone providing the major contribution to the variability in each cluster (variable importance in the projection >1.5). In logistic models adjusted by age, sex, type 2 diabetes mellitus, hypertension, and nutritional status, phenylalanine was associated with critical outcomes (odds ratio=5.3 (95% CI 3.16-9.2) in the severe vs. critical model, with an area under the curve of 0.84 (95% CI 0.77-0.90). In conclusion the metabolic imbalance in COVID-19 patients might affect disease progression. This work shows an association of phenylalanine with critical outcomes in COVID-19 patients, highlighting phenylalanine as a potential metabolic biomarker of disease severity.

Indexed as

COVID-19Diabetes Mellitus, Type 2Amino AcidsCross-Sectional StudiesHumansPhenylalanineSARS-CoV-2Amino AcidsPhenylalanineamino acidsCOVID-19metabolomicsphenylalanineSARS – CoV – 2

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PMID36341434
PMCPMC9634751
OpenAlexW4308679561

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