Evidence map›Paper›PMID 35747620›Full record

ArticleNew microbes and new infections

Heterogeneity of the Omicron variant in Senegal.

Cyrille Kouligueul Diédhiou, Abdou Padane, Khadim Gueye, Samba Ndiour, Aminata Mboup, Moustapha Mbow, Cheikh Ibrahima Lo, Nafissatou Leye, Aissatou Sow Ndoye, Anna Julienne Selbé Ndiaye and 14 more

Abstract read
PubMed Full text at PMC Publisher
In one paragraph

Article in New microbes and new infections. The graph could read no effect estimate from its abstract, so it casts no vote on the map. Not yet cited in PubMed.

0numbers the graph read from it
0cells of the map it votes in
0citing papers in PubMed
–field-weighted citation impact
1 · What the graph read from it

What it found

Each row is one number read from the abstract, on the scale the paper reported it, with its interval. Left of the dashed line favours the treatment, right favours the comparator. Under each row is the sentence it came from. New to these charts? A ten-minute tutorial.

The abstract states no effect estimate the extractor could read, or names no intervention and outcome on the map, so this paper lights no cell and moves no belief. It is still indexed, cited and linked below.

2 · The registry

The trial behind it

Trials whose registry record cites this paper, or whose number appears in the abstract. A trial that started after this paper was published is citing it as background, not reporting it.

Neither the registry nor the abstract names a trial number. If this is a trial report, that itself is worth knowing.

3 · Its place in the literature

Who cites it

0 citing papers in PubMed.

No citing paper in PubMed yet.

4 · The record

Corrections and comments

PubMed lists nothing against this paper. Absence here is not a guarantee, only a check that was made.

5 · Who and what money

Authors and funding

24 authors.

Cyrille Kouligueul DiédhiouInstitut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formations (IRESSEF), Dakar, Sénégal.
Abdou PadaneInstitut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formations (IRESSEF), Dakar, Sénégal.
Khadim GueyeInstitut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formations (IRESSEF), Dakar, Sénégal.
Samba NdiourInstitut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formations (IRESSEF), Dakar, Sénégal.
Aminata MboupInstitut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formations (IRESSEF), Dakar, Sénégal.
Moustapha MbowInstitut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formations (IRESSEF), Dakar, Sénégal.
Cheikh Ibrahima LoIHU Méditerranée Infection, Marseille, France.
Nafissatou LeyeInstitut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formations (IRESSEF), Dakar, Sénégal.
Aissatou Sow NdoyeInstitut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formations (IRESSEF), Dakar, Sénégal.
Anna Julienne Selbé NdiayeInstitut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formations (IRESSEF), Dakar, Sénégal.
Ndéye Diabou DiagneInstitut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formations (IRESSEF), Dakar, Sénégal.
Seyni NdiayeInstitut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formations (IRESSEF), Dakar, Sénégal.
Yacine Amet DiaInstitut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formations (IRESSEF), Dakar, Sénégal.
Gora LoInstitut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formations (IRESSEF), Dakar, Sénégal.
Djibril WadeInstitut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formations (IRESSEF), Dakar, Sénégal.
Papa Alassane DiawInstitut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formations (IRESSEF), Dakar, Sénégal.
Marièma SarrInstitut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formations (IRESSEF), Dakar, Sénégal.
Mamadou BeyeInstitut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formations (IRESSEF), Dakar, Sénégal.
Badara CisséInstitut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formations (IRESSEF), Dakar, Sénégal.
Cheikh SokhnaIHU Méditerranée Infection, Marseille, France.
Makhtar CamaraInstitut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formations (IRESSEF), Dakar, Sénégal.
Ambroise AhouidiInstitut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formations (IRESSEF), Dakar, Sénégal.
Ndéye Coumba Touré KaneInstitut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formations (IRESSEF), Dakar, Sénégal.
Souleymane MboupInstitut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formations (IRESSEF), Dakar, Sénégal.

Funding

University of Washington Arboviral Research Network (UWARN)U01AI151698 · NIAID · UNIVERSITY OF WASHINGTON · PI Michael Gale, PETER MACGARR RABINOWITZ · 2020 to 2026
$13.3M
NIAID NIH HHS U01 AI151698
6 · The paper itself

Abstract

•Omicron variant continues to progress in Senegal with the appearance of new contaminations.•IRESSEF detected the first positive case of the Omicron variant on Friday, December 3, 2021.•Since this date, the number of Omicron variant infections has increased over the weeks.•Molecular surveillance of the Omicron variant allowed us to identify a strong variation of this variant in our country.

Indexed as

COVID-19genomicslineagesOmicron variantSARS-CoV-2

Identifiers

PMID35747620
PMCPMC9212870

What OpenQuestion holds

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LicenceCC BY-NC-ND
Read underepoch 390

Registered trials

None linked

Read under generation 80e0d062 · epoch 390. Bibliography from PubMed, PubMed Central and OpenAlex; grants from NIH RePORTER; trial links from ClinicalTrials.gov; estimates, votes and beliefs from the OpenQuestion graph.