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ArticleJournal of bacteriology2022

An Extracytoplasmic Function Sigma Factor Required for Full Virulence in Xanthomonas citri pv. citri.

Lídia Dos Passos Lima, Juliana Biar Pereira, Anthony Jhoao Fasabi Flores, Alan Péricles Rodrigues Lorenzetti, Ana Laura Boechat, Maria Claudia Pereda, Sophia Gualtieri, Daniele Ferreira do Prado, Diego Rocha, Lucas de Moraes Ceseti and 5 more

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In one paragraph

Article in Journal of bacteriology, 2022. The graph could read no effect estimate from its abstract, so it casts no vote on the map. Cited by 1 paper.

0numbers the graph read from it
0cells of the map it votes in
1citing papers in PubMed
0.6field-weighted citation impact, top 25% of its field
1 · What the graph read from it

What it found

Each row is one number read from the abstract, on the scale the paper reported it, with its interval. Left of the dashed line favours the treatment, right favours the comparator. Under each row is the sentence it came from. New to these charts? A ten-minute tutorial.

The abstract states no effect estimate the extractor could read, or names no intervention and outcome on the map, so this paper lights no cell and moves no belief. It is still indexed, cited and linked below.

2 · The registry

The trial behind it

Trials whose registry record cites this paper, or whose number appears in the abstract. A trial that started after this paper was published is citing it as background, not reporting it.

Neither the registry nor the abstract names a trial number. If this is a trial report, that itself is worth knowing.

3 · Its place in the literature

Who cites it

1 citing paper in PubMed, 3 citations in OpenAlex.

  1. Cleavage cascade of the sigma regulator FecR orchestrates TonB-dependent signal transduction.Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America · 2025
    Article
4 · The record

Corrections and comments

PubMed lists nothing against this paper. Absence here is not a guarantee, only a check that was made.

5 · Who and what money

Authors and funding

15 authors at 4 institutions in 1 country.

Lídia Dos Passos Lima *Departamento de Genética, Evolução, Microbiologia e Imunologia, Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, São Paulo, Brazil.ORCID 0000-0001-8806-1948
Juliana Biar Pereira *Departamento de Genética, Evolução, Microbiologia e Imunologia, Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, São Paulo, Brazil.
Anthony Jhoao Fasabi FloresDepartamento de Genética, Evolução, Microbiologia e Imunologia, Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, São Paulo, Brazil.
Alan Péricles Rodrigues LorenzettiDepartamento de Bioquímica e Imunologia, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.ORCID 0000-0002-0291-248X
Ana Laura BoechatDepartamento de Bioquímica, Instituto de Química, Universidade de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil.
Maria Claudia PeredaDepartamento de Bioquímica, Instituto de Química, Universidade de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil.
Sophia GualtieriDepartamento de Genética, Evolução, Microbiologia e Imunologia, Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, São Paulo, Brazil.
Daniele Ferreira do PradoDepartamento de Genética, Evolução, Microbiologia e Imunologia, Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, São Paulo, Brazil.
Diego RochaDepartamento de Genética, Evolução, Microbiologia e Imunologia, Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, São Paulo, Brazil.
Lucas de Moraes CesetiDepartamento de Genética, Evolução, Microbiologia e Imunologia, Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, São Paulo, Brazil.
Regina Lúcia BaldiniDepartamento de Bioquímica, Instituto de Química, Universidade de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil.ORCID 0000-0003-4349-6352
Chuck S FarahDepartamento de Bioquímica, Instituto de Química, Universidade de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil.
Tie KoideDepartamento de Bioquímica e Imunologia, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.
Celso Eduardo BenedettiBrazilian Biosciences National Laboratory (LNBio), Brazilian Center for Research in Energy and Materials (CNPEM), Campinas, São Paulo, Brazil.
Cristina E Alvarez-MartinezDepartamento de Genética, Evolução, Microbiologia e Imunologia, Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, São Paulo, Brazil.ORCID 0000-0003-3882-1835
Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) · BRUniversidade de São Paulo · BRUniversidade de Ribeirão Preto · BRBrazilian Center for Research in Energy and Materials · BR

Funding

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) 001Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) 04/10916-3Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) 2013/21597-5Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) 2017/02318-9Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) 2017/03052-2Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) 2018/01852-4Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) 2019/03406-4MCTI | Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)MCTI | Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) 133118/2017-7MCTI | Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) 301627/2019-3UNICAMP | Fundo de Apoio ao Ensino, à Pesquisa e Extensão, Universidade Estadual de Campinas (FAEPEX, UNICAMP)
6 · The paper itself

Abstract

The genus Xanthomonas includes more than 30 phytopathogenic species that infect a wide range of plants and cause severe diseases that greatly impact crop productivity. These bacteria are highly adapted to the soil and plant environment, being found in decaying material, as epiphytes, and colonizing the plant mesophyll. Signal transduction mechanisms involved in the responses of

Indexed as

CitrusXanthomonasBacterial ProteinsIronPlant DiseasesSigma FactorSoilVirulenceBacterial ProteinsIronSigma FactorSoilphytopathogensregulation of gene expressionsigma factors

Identifiers

PMID35446118
PMCPMC9112872
OpenAlexW4224234860

What OpenQuestion holds

Textmetadata
Read underepoch 390

Registered trials

None linked

Read under generation 80e0d062 · epoch 390. Bibliography from PubMed, PubMed Central and OpenAlex; grants from NIH RePORTER; trial links from ClinicalTrials.gov; estimates, votes and beliefs from the OpenQuestion graph.