Evidence map›Paper›PMID 35087128›Full record

ArticleScientific reports2022

Revealing the differential protein profiles behind the nitrogen use efficiency in popcorn (Zea mays var. everta).

Shahid Khan, Vitor Batista Pinto, Antônio Teixeira do Amaral Júnior, Gabriel Moreno Bernardo Gonçalves, Caio Cézar Guedes Corrêa, Fernando Rafael Alves Ferreira, Guilherme Augusto Rodrigues de Souza, Eliemar Campostrini, Marta Simone Mendonça Freitas, Marlene Evangelista Vieira and 7 more

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In one paragraph

Article in Scientific reports, 2022. The graph could read no effect estimate from its abstract, so it casts no vote on the map. Cited by 5 papers.

0numbers the graph read from it
0cells of the map it votes in
5citing papers in PubMed
2.5field-weighted citation impact, top 11% of its field
1 · What the graph read from it

What it found

Each row is one number read from the abstract, on the scale the paper reported it, with its interval. Left of the dashed line favours the treatment, right favours the comparator. Under each row is the sentence it came from. New to these charts? A ten-minute tutorial.

The abstract states no effect estimate the extractor could read, or names no intervention and outcome on the map, so this paper lights no cell and moves no belief. It is still indexed, cited and linked below.

2 · The registry

The trial behind it

Trials whose registry record cites this paper, or whose number appears in the abstract. A trial that started after this paper was published is citing it as background, not reporting it.

Neither the registry nor the abstract names a trial number. If this is a trial report, that itself is worth knowing.

3 · Its place in the literature

Who cites it

5 citing papers in PubMed, 14 citations in OpenAlex.

  1. Article
  2. Article
  3. Article
  4. Article
  5. Article
4 · The record

Corrections and comments

PubMed lists nothing against this paper. Absence here is not a guarantee, only a check that was made.

5 · Who and what money

Authors and funding

17 authors at 3 institutions in 2 countries.

Shahid Khan *Laboratório de Melhoramento Genético Vegetal, Centro de Ciências e Tecnologias Agropecuárias, Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (UENF), Av. Alberto Lamego, 2000, Campos dos Goytacazes, Rio de Janeiro, 28013-602, Brazil.
Vitor Batista Pinto *Laboratório de Biotecnologia, Centro de Biociências e Biotecnologia, Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (UENF), Av. Alberto Lamego, 2000, Campos dos Goytacazes, Rio de Janeiro, 28013-602, Brazil. vitorbp@uenf.br.
Antônio Teixeira do Amaral JúniorLaboratório de Melhoramento Genético Vegetal, Centro de Ciências e Tecnologias Agropecuárias, Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (UENF), Av. Alberto Lamego, 2000, Campos dos Goytacazes, Rio de Janeiro, 28013-602, Brazil. amaraljr@uenf.br.
Gabriel Moreno Bernardo GonçalvesLaboratório de Melhoramento Genético Vegetal, Centro de Ciências e Tecnologias Agropecuárias, Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (UENF), Av. Alberto Lamego, 2000, Campos dos Goytacazes, Rio de Janeiro, 28013-602, Brazil.
Caio Cézar Guedes CorrêaLaboratório de Melhoramento Genético Vegetal, Centro de Ciências e Tecnologias Agropecuárias, Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (UENF), Av. Alberto Lamego, 2000, Campos dos Goytacazes, Rio de Janeiro, 28013-602, Brazil.
Fernando Rafael Alves FerreiraLaboratório de Fitotecnia-Setor de Nutrição Mineral de Plantas, Centro de Ciências e Tecnologias Agropecuárias, Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (UENF), Av. Alberto Lamego, 2000, Campos dos Goytacazes, Rio de Janeiro, 28013-602, Brazil.
Guilherme Augusto Rodrigues de SouzaLaboratório de Melhoramento Genético Vegetal-Setor de Fisiologia Vegetal, Centro de Ciências e Tecnologias Agropecuárias, Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (UENF), Av. Alberto Lamego, 2000, Campos dos Goytacazes, Rio de Janeiro, 28013-602, Brazil.
Eliemar CampostriniLaboratório de Melhoramento Genético Vegetal-Setor de Fisiologia Vegetal, Centro de Ciências e Tecnologias Agropecuárias, Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (UENF), Av. Alberto Lamego, 2000, Campos dos Goytacazes, Rio de Janeiro, 28013-602, Brazil.
Marta Simone Mendonça FreitasLaboratório de Fitotecnia-Setor de Nutrição Mineral de Plantas, Centro de Ciências e Tecnologias Agropecuárias, Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (UENF), Av. Alberto Lamego, 2000, Campos dos Goytacazes, Rio de Janeiro, 28013-602, Brazil.
Marlene Evangelista VieiraLaboratório de Fitotecnia-Setor de Nutrição Mineral de Plantas, Centro de Ciências e Tecnologias Agropecuárias, Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (UENF), Av. Alberto Lamego, 2000, Campos dos Goytacazes, Rio de Janeiro, 28013-602, Brazil.
Talles de Oliveira SantosLaboratório de Melhoramento Genético Vegetal, Centro de Ciências e Tecnologias Agropecuárias, Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (UENF), Av. Alberto Lamego, 2000, Campos dos Goytacazes, Rio de Janeiro, 28013-602, Brazil.
Valter Jário de LimaLaboratório de Melhoramento Genético Vegetal, Centro de Ciências e Tecnologias Agropecuárias, Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (UENF), Av. Alberto Lamego, 2000, Campos dos Goytacazes, Rio de Janeiro, 28013-602, Brazil.
Samuel Henrique KamphorstLaboratório de Melhoramento Genético Vegetal, Centro de Ciências e Tecnologias Agropecuárias, Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (UENF), Av. Alberto Lamego, 2000, Campos dos Goytacazes, Rio de Janeiro, 28013-602, Brazil.
José Francisco Teixeira do AmaralDepartamento de Engenharia Rural, Centro de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Espírito Santo (UFES), Alto Universitário, s/nº, Alegre, Espírito Santo, 29500-000, Brazil.
Freddy Mora-PobleteInstituto de Ciencias Biológicas, Universidad de Talca, 1 Poniente 1141, 3460000, Talca, Chile.
Gonçalo Apolinário de Souza FilhoLaboratório de Biotecnologia, Centro de Biociências e Biotecnologia, Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (UENF), Av. Alberto Lamego, 2000, Campos dos Goytacazes, Rio de Janeiro, 28013-602, Brazil.
Vanildo SilveiraLaboratório de Biotecnologia, Centro de Biociências e Biotecnologia, Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (UENF), Av. Alberto Lamego, 2000, Campos dos Goytacazes, Rio de Janeiro, 28013-602, Brazil.
State University of Norte Fluminense · BRUniversidade Federal do Espírito Santo · BRUniversity of Talca · CL

Funding

No grant is acknowledged in the PubMed record.

6 · The paper itself

Abstract

We investigated the proteomic profiles of two popcorn inbred lines, P2 (N-efficient and N-responsive) and L80 (N-inefficient and nonresponsive to N), under low (10% of N supply) and high (100% of N supply) nitrogen environments, associated with agronomic- and physiological-related traits to NUE. The comparative proteomic analysis allowed the identification of 79 differentially accumulated proteins (DAPs) in the comparison of high/low N for P2 and 96 DAPs in the comparison of high/low N for L80. The NUE and N uptake efficiency (NUpE) presented high means in P2 in comparison to L80 at both N levels, but the NUE, NUpE, and N utilization efficiency (NUtE) rates decreased in P2 under a high N supply. DAPs involved in energy and carbohydrate metabolism suggested that N regulates enzymes of alternative pathways to adapt to energy shortages and that fructose-bisphosphate aldolase may act as one of the key primary nitrate responsive proteins in P2. Proteins related to ascorbate biosynthesis and nitrogen metabolism increased their regulation in P2, and the interaction of L-ascorbate peroxidase and Fd-NiR may play an important role in the NUE trait. Taken together, our results provide new insights into the proteomic changes taking place in contrasting inbred lines, providing useful information on the genetic improvement of NUE in popcorn.

Indexed as

NitrogenPlant ProteinsProteomicsZea maysGene Expression Regulation, PlantProteomeNitrogenPlant ProteinsProteome

Identifiers

PMID35087128
PMCPMC8795358
OpenAlexW4210404195

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LicenceCC BY
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Registered trials

None linked

Read under generation 80e0d062 · epoch 390. Bibliography from PubMed, PubMed Central and OpenAlex; grants from NIH RePORTER; trial links from ClinicalTrials.gov; estimates, votes and beliefs from the OpenQuestion graph.