Evidence map›Paper›PMID 33248817›Full record

ArticleArchives of medical research2021

A Shift Towards an Immature Myeloid Profile in Peripheral Blood of Critically Ill COVID-19 Patients.

Eduardo Vadillo, Keiko Taniguchi-Ponciano, Constantino Lopez-Macias, Roberto Carvente-Garcia, Hector Mayani, Eduardo Ferat-Osorio, Guillermo Flores-Padilla, Javier Torres, Cesar Raul Gonzalez-Bonilla, Abraham Majluf and 26 more

Open access · greenAbstract read
In one paragraph

Article in Archives of medical research, 2021. The graph could read no effect estimate from its abstract, so it casts no vote on the map. Cited by 11 papers.

0numbers the graph read from it
0cells of the map it votes in
11citing papers in PubMed
0.3field-weighted citation impact, top 27% of its field
1 · What the graph read from it

What it found

Each row is one number read from the abstract, on the scale the paper reported it, with its interval. Left of the dashed line favours the treatment, right favours the comparator. Under each row is the sentence it came from. New to these charts? A ten-minute tutorial.

The abstract states no effect estimate the extractor could read, or names no intervention and outcome on the map, so this paper lights no cell and moves no belief. It is still indexed, cited and linked below.

2 · The registry

The trial behind it

Trials whose registry record cites this paper, or whose number appears in the abstract. A trial that started after this paper was published is citing it as background, not reporting it.

Neither the registry nor the abstract names a trial number. If this is a trial report, that itself is worth knowing.

3 · Its place in the literature

Who cites it

11 citing papers in PubMed, 20 citations in OpenAlex.

  1. Vitamin D Reprograms Non-Coding RNA Networks to Block Zika Virus in Human Macrophages.Pathophysiology : the official journal of the International Society for Pathophysiology · 2026
    Article
  2. Article
  3. Article
  4. Article
  5. Article
  6. Review
  7. Article
  8. Review
  9. Review
  10. Article
  11. Article
4 · The record

Corrections and comments

PubMed lists nothing against this paper. Absence here is not a guarantee, only a check that was made.

5 · Who and what money

Authors and funding

36 authors at 3 institutions in 1 country.

Eduardo VadilloUnidad de Investigación Médica en Enfermedades Oncológicas, Hospital de Oncología, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Keiko Taniguchi-PoncianoUnidad de Investigación Médica en Enfermedades Endocrinas, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Constantino Lopez-MaciasUnidad de Investigación Médica en Inmunoquimica, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Roberto Carvente-GarciaUnidad de Investigación Médica en Enfermedades Endocrinas, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México; Analitek S.A. de C.V, Ciudad de México, México.
Hector MayaniUnidad de Investigación Médica en Enfermedades Oncológicas, Hospital de Oncología, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Eduardo Ferat-OsorioDivision de Investigacion en Salud, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Guillermo Flores-PadillaServicio de Medicina Interna, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Javier TorresUnidad de Investigación Médica en Enfermedades Infecciosas y Parasitarias, Hospital de Pediatria, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Cesar Raul Gonzalez-BonillaCoordinación de Investigación en Salud, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Abraham MajlufUnidad de Investigación Médica en trombosis, hemostasia y aterogenesis, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Alejandra Albarran-SanchezServicio de Medicina Interna, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Juan Carlos GalanServicio de Medicina Interna, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Eduardo Peña-MartínezUnidad de Investigación Médica en Enfermedades Endocrinas, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Gloria Silva-RománUnidad de Investigación Médica en Enfermedades Endocrinas, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Sandra Vela-PatiñoUnidad de Investigación Médica en Enfermedades Endocrinas, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Aldo Ferreira-HermosilloUnidad de Investigación Médica en Enfermedades Endocrinas, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Claudia Ramirez-RenteriaUnidad de Investigación Médica en Enfermedades Endocrinas, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Nancy Adriana Espinoza-SanchezUnidad de Investigación Médica en Enfermedades Oncológicas, Hospital de Oncología, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Rosana Pelayo-CamachoCentro de Investigación Biomedica de Oriente, Instituto Mexicano del Seguro Social, Puebla, México.
Laura BonifazUnidad de Investigación Médica en Inmunoquimica, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Lourdes Arriaga-PizanoUnidad de Investigación Médica en Inmunoquimica, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Carlos Mata-LozanoUnidad de Investigación Médica en Enfermedades Endocrinas, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México; Analitek S.A. de C.V, Ciudad de México, México.
Sergio Andonegui-ElgueraUnidad de Investigación Médica en Enfermedades Endocrinas, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Niels WacherUnidad de Investigación Médica en Epidemiologia Clinica, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Francisco Blanco-FavelaUnidad de Investigación Médica en Inmunología, Hospital de Pediatría, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Roberto De-Lira-BarrazaServicio de Medicina Interna, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Humberto Villanueva-CompeanServicio de Medicina Interna, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Alejandra Esquivel-PinedaServicio de Medicina Interna, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Rubén Ramírez-Montes-de-OcaServicio de Medicina Interna, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Carlos Anda-GarayServicio de Medicina Interna, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Maura Noyola-GarcíaServicio de Medicina Interna, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Luis Guizar-GarcíaServicio de Medicina Interna, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Arturo Cerbulo-VazquezUnidad de Investigación Médica en Inmunoquimica, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Horacio Zamudio-MezaUnidad de Investigación Médica en Inmunoquimica, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México.
Daniel Marrero-RodríguezUnidad de Investigación Médica en Enfermedades Endocrinas, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México. Electronic address: dan.mar57@gmail.com.
Moises MercadoUnidad de Investigación Médica en Enfermedades Endocrinas, Hospital de Especialidades, Centro Medico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México. Electronic address: moises.mercado@endocrinologia.org.mx.
Mexican Social Security Institute · MXCentro Medico Nacional Siglo XXI · MXHospital de Especialidades · MX

Funding

No grant is acknowledged in the PubMed record.

6 · The paper itself

Abstract

backgroundSARS-CoV-2, the etiological agent causing COVID-19, has infected more than 27 million people with over 894000 deaths worldwide since its emergence in December 2019. Factors for severe diseases, such as diabetes, hypertension, and obesity have been identified however, the precise pathogenesis is poorly understood. To understand its pathophysiology and to develop effective therapeutic strategies, it is essential to define the prevailing immune cellular subsets.

methodsWe performed whole circulating immune cells scRNAseq from five critically ill COVID-19 patients, trajectory and gene ontology analysis.

resultsImmature myeloid populations, such as promyelocytes-myelocytes, metamyelocytes, band neutrophils, monocytoid precursors, and activated monocytes predominated. The trajectory with pseudotime analysis supported the finding of immature cell states. While the gene ontology showed myeloid cell activation in immune response, DNA and RNA processing, defense response to the virus, and response to type 1 interferon. Lymphoid lineage was scarce. Expression of genes such as C/EBPβ, IRF1and FOSL2 potentially suggests the induction of trained immunity.

conclusionsOur results uncover transcriptomic profiles related to immature myeloid lineages and suggest the potential induction of trained immunity.

Indexed as

COVID-19Critical IllnessHumansMyeloid CellsSARS-CoV-2COVID-19Critically illEmergency myelopoiesisImmune cell profileSARS-CoV-2scRNAseqTrained immunity

Identifiers

PMID33248817
PMCPMC7670924
OpenAlexW3101870054

What OpenQuestion holds

Textmetadata
Read underepoch 390

Registered trials

None linked

Read under generation 80e0d062 · epoch 390. Bibliography from PubMed, PubMed Central and OpenAlex; grants from NIH RePORTER; trial links from ClinicalTrials.gov; estimates, votes and beliefs from the OpenQuestion graph.