ArticleCurrent genomics2020
Genome Sequence of a Highly Virulent
Open access · greenAbstract read
In one paragraph
Article in Current genomics, 2020. The graph could read no effect estimate from its abstract, so it casts no vote on the map. Cited by 4 papers.
0numbers the graph read from it
0cells of the map it votes in
4citing papers in PubMed
0.1field-weighted citation impact, top 55% of its field
What it found
Each row is one number read from the abstract, on the scale the paper reported it, with its interval. Left of the dashed line favours the treatment, right favours the comparator. Under each row is the sentence it came from. New to these charts? A ten-minute tutorial.
The abstract states no effect estimate the extractor could read, or names no intervention and outcome on the map, so this paper lights no cell and moves no belief. It is still indexed, cited and linked below.
The trial behind it
Trials whose registry record cites this paper, or whose number appears in the abstract. A trial that started after this paper was published is citing it as background, not reporting it.
Neither the registry nor the abstract names a trial number. If this is a trial report, that itself is worth knowing.
Who cites it
4 citing papers in PubMed, 4 citations in OpenAlex.
- Decoding the evolutionary history of ST30Frontiers in microbiology · 2025Article
- Detection of Vancomycin Resistance among Methicillin-ResistantAntibiotics (Basel, Switzerland) · 2024Article
- Draft genome sequence of Staphylococcus aureus sequence type 5 SA01 isolated from bloodstream infection and comparative analysis with reference strains.Functional & integrative genomics · 2023Article
- Panton-Valentine leukocidin (PVL) isoforms among Staphylococcus aureus lineages isolated from hospitals in Rio de Janeiro, Brazil.Brazilian journal of microbiology : [publication of the Brazilian Society for Microbiology] · 2020Article
Corrections and comments
PubMed lists nothing against this paper. Absence here is not a guarantee, only a check that was made.
Authors and funding
9 authors at 3 institutions in 1 country.
Raiane C Chamon1Departamento de Patologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal Fluminense, Niterói, Brazil; 2Laboratório de Infecção Hospitalar, Departamento de Microbiologia Médica, Instituto de Microbiologia Paulo de Góes, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil; 3Instituto Multidisciplinar em Saúde, Universidade Federal da Bahia, Bahia, Brazil; 4Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil; 5Departamento de Microbiologia Geral, Instituto de Microbiologia Paulo de Góes, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil; 6Laboratório de Bacteriologia e Imunologia Clínica, Departamento de Análises Clínicas e Toxicológicas, Faculdade de Farmácia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil.
Lucas M Marques1Departamento de Patologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal Fluminense, Niterói, Brazil; 2Laboratório de Infecção Hospitalar, Departamento de Microbiologia Médica, Instituto de Microbiologia Paulo de Góes, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil; 3Instituto Multidisciplinar em Saúde, Universidade Federal da Bahia, Bahia, Brazil; 4Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil; 5Departamento de Microbiologia Geral, Instituto de Microbiologia Paulo de Góes, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil; 6Laboratório de Bacteriologia e Imunologia Clínica, Departamento de Análises Clínicas e Toxicológicas, Faculdade de Farmácia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil.
Jorge Timenetsky1Departamento de Patologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal Fluminense, Niterói, Brazil; 2Laboratório de Infecção Hospitalar, Departamento de Microbiologia Médica, Instituto de Microbiologia Paulo de Góes, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil; 3Instituto Multidisciplinar em Saúde, Universidade Federal da Bahia, Bahia, Brazil; 4Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil; 5Departamento de Microbiologia Geral, Instituto de Microbiologia Paulo de Góes, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil; 6Laboratório de Bacteriologia e Imunologia Clínica, Departamento de Análises Clínicas e Toxicológicas, Faculdade de Farmácia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil.
Caio T C da Costa Rachid1Departamento de Patologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal Fluminense, Niterói, Brazil; 2Laboratório de Infecção Hospitalar, Departamento de Microbiologia Médica, Instituto de Microbiologia Paulo de Góes, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil; 3Instituto Multidisciplinar em Saúde, Universidade Federal da Bahia, Bahia, Brazil; 4Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil; 5Departamento de Microbiologia Geral, Instituto de Microbiologia Paulo de Góes, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil; 6Laboratório de Bacteriologia e Imunologia Clínica, Departamento de Análises Clínicas e Toxicológicas, Faculdade de Farmácia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil.
Rosana B R Ferreira1Departamento de Patologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal Fluminense, Niterói, Brazil; 2Laboratório de Infecção Hospitalar, Departamento de Microbiologia Médica, Instituto de Microbiologia Paulo de Góes, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil; 3Instituto Multidisciplinar em Saúde, Universidade Federal da Bahia, Bahia, Brazil; 4Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil; 5Departamento de Microbiologia Geral, Instituto de Microbiologia Paulo de Góes, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil; 6Laboratório de Bacteriologia e Imunologia Clínica, Departamento de Análises Clínicas e Toxicológicas, Faculdade de Farmácia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil.
Tamara L R de Oliveira1Departamento de Patologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal Fluminense, Niterói, Brazil; 2Laboratório de Infecção Hospitalar, Departamento de Microbiologia Médica, Instituto de Microbiologia Paulo de Góes, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil; 3Instituto Multidisciplinar em Saúde, Universidade Federal da Bahia, Bahia, Brazil; 4Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil; 5Departamento de Microbiologia Geral, Instituto de Microbiologia Paulo de Góes, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil; 6Laboratório de Bacteriologia e Imunologia Clínica, Departamento de Análises Clínicas e Toxicológicas, Faculdade de Farmácia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil.
Thais Glatthardt1Departamento de Patologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal Fluminense, Niterói, Brazil; 2Laboratório de Infecção Hospitalar, Departamento de Microbiologia Médica, Instituto de Microbiologia Paulo de Góes, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil; 3Instituto Multidisciplinar em Saúde, Universidade Federal da Bahia, Bahia, Brazil; 4Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil; 5Departamento de Microbiologia Geral, Instituto de Microbiologia Paulo de Góes, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil; 6Laboratório de Bacteriologia e Imunologia Clínica, Departamento de Análises Clínicas e Toxicológicas, Faculdade de Farmácia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil.
Lilian de Oliveira Moreira1Departamento de Patologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal Fluminense, Niterói, Brazil; 2Laboratório de Infecção Hospitalar, Departamento de Microbiologia Médica, Instituto de Microbiologia Paulo de Góes, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil; 3Instituto Multidisciplinar em Saúde, Universidade Federal da Bahia, Bahia, Brazil; 4Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil; 5Departamento de Microbiologia Geral, Instituto de Microbiologia Paulo de Góes, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil; 6Laboratório de Bacteriologia e Imunologia Clínica, Departamento de Análises Clínicas e Toxicológicas, Faculdade de Farmácia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil.
Kátia R N Dos Santos1Departamento de Patologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal Fluminense, Niterói, Brazil; 2Laboratório de Infecção Hospitalar, Departamento de Microbiologia Médica, Instituto de Microbiologia Paulo de Góes, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil; 3Instituto Multidisciplinar em Saúde, Universidade Federal da Bahia, Bahia, Brazil; 4Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil; 5Departamento de Microbiologia Geral, Instituto de Microbiologia Paulo de Góes, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil; 6Laboratório de Bacteriologia e Imunologia Clínica, Departamento de Análises Clínicas e Toxicológicas, Faculdade de Farmácia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro · BRUniversidade de São Paulo · BRUniversidade Federal da Bahia · BR
Funding
No grant is acknowledged in the PubMed record.
Abstract
background
objectiveThe aim of this work was to sequence the genome of a
methodsThe 13420 genome was sequenced using the HiSeq 2500 platform. The draft genome, plasmids annotation, and genome analysis were performed using RAST. Comparison of the relative
resultsThe isolate presented the ϕPVL phage codifying for the H2b PVL protein isoform, and another prophage carrying a PVL variant named
conclusionWe described for the first time the genome sequence of a VISA isolate harboring two
Indexed as
MRSApvl-positiveS. aureusUSA1100/ST30virulenceVISA
Identifiers
What OpenQuestion holds
Textmetadata
LicenceCC BY-NC
Read underepoch 390
Registered trials
None linked
Read under generation 80e0d062 · epoch 390. Bibliography from PubMed, PubMed Central and OpenAlex; grants from NIH RePORTER; trial links from ClinicalTrials.gov; estimates, votes and beliefs from the OpenQuestion graph.