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ArticleMemorias do Instituto Oswaldo Cruz2016

A real-time reverse transcriptase polymerase chain reaction for detection and quantification of Vesiculovirus.

Aline Lavado Tolardo, William Marciel de Souza, Marilia Farignoli Romeiro, Luiz Carlos Vieira, Luciano Kleber de Souza Luna, Dyana Alves Henriques, Jansen de Araujo, Carlos Eduardo Hassegawa Siqueira, Tatiana Elias Colombo, Victor Hugo Aquino and 5 more

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In one paragraph

Article in Memorias do Instituto Oswaldo Cruz, 2016. The graph could read no effect estimate from its abstract, so it casts no vote on the map. Cited by 2 papers.

0numbers the graph read from it
0cells of the map it votes in
2citing papers in PubMed
0.5field-weighted citation impact, top 30% of its field
1 · What the graph read from it

What it found

Each row is one number read from the abstract, on the scale the paper reported it, with its interval. Left of the dashed line favours the treatment, right favours the comparator. Under each row is the sentence it came from. New to these charts? A ten-minute tutorial.

The abstract states no effect estimate the extractor could read, or names no intervention and outcome on the map, so this paper lights no cell and moves no belief. It is still indexed, cited and linked below.

2 · The registry

The trial behind it

Trials whose registry record cites this paper, or whose number appears in the abstract. A trial that started after this paper was published is citing it as background, not reporting it.

Neither the registry nor the abstract names a trial number. If this is a trial report, that itself is worth knowing.

3 · Its place in the literature

Who cites it

2 citing papers in PubMed, 6 citations in OpenAlex.

  1. Article
  2. Article
4 · The record

Corrections and comments

PubMed lists nothing against this paper. Absence here is not a guarantee, only a check that was made.

5 · Who and what money

Authors and funding

15 authors at 4 institutions in 1 country.

Aline Lavado TolardoUniversidade de São Paulo, Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Centro de Pesquisa em Virologia, Ribeirão Preto SP , Brasil, Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Centro de Pesquisa em Virologia, Ribeirão Preto, SP, Brasil.
William Marciel de SouzaUniversidade de São Paulo, Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Centro de Pesquisa em Virologia, Ribeirão Preto SP , Brasil, Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Centro de Pesquisa em Virologia, Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Marilia Farignoli RomeiroUniversidade de São Paulo, Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Centro de Pesquisa em Virologia, Ribeirão Preto SP , Brasil, Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Centro de Pesquisa em Virologia, Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Luiz Carlos VieiraUniversidade de São Paulo, Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Centro de Pesquisa em Virologia, Ribeirão Preto SP , Brasil, Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Centro de Pesquisa em Virologia, Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Luciano Kleber de Souza LunaUniversidade de São Paulo, Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Centro de Pesquisa em Virologia, Ribeirão Preto SP , Brasil, Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Centro de Pesquisa em Virologia, Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Dyana Alves HenriquesUniversidade de São Paulo, Universidade de São Paulo, Instituto de Ciências Biomédicas, Laboratório de Virologia Clínica e Molecular, São Paulo SP , Brasil, Universidade de São Paulo, Instituto de Ciências Biomédicas, Laboratório de Virologia Clínica e Molecular, São Paulo, SP, Brasil.
Jansen de AraujoUniversidade de São Paulo, Universidade de São Paulo, Instituto de Ciências Biomédicas, Laboratório de Virologia Clínica e Molecular, São Paulo SP , Brasil, Universidade de São Paulo, Instituto de Ciências Biomédicas, Laboratório de Virologia Clínica e Molecular, São Paulo, SP, Brasil.
Carlos Eduardo Hassegawa SiqueiraUniversidade Federal de Mato Grosso, Universidade Federal de Mato Grosso, Instituto de Ciências da Saúde, Centro Universitário de Sinop, Sinop MT , Brasil, Universidade Federal de Mato Grosso, Instituto de Ciências da Saúde, Centro Universitário de Sinop, Sinop, MT, Brasil.
Tatiana Elias ColomboFaculdade de Medicina de São José do Rio Preto, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, Laboratório de Pesquisa em Virologia, São José do Rio Preto SP , Brasil, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, Laboratório de Pesquisa em Virologia, São José do Rio Preto, SP, Brasil.
Victor Hugo AquinoUniversidade de São Paulo, Universidade de São Paulo, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Análises Clínicas, Toxicológicas e Bromatológicas, Ribeirão Preto SP , Brasil, Universidade de São Paulo, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Análises Clínicas, Toxicológicas e Bromatológicas, Laboratório de Virologia, Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Benedito Antonio Lopes da FonsecaUniversidade de São Paulo, Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Centro de Pesquisa em Virologia, Ribeirão Preto SP , Brasil, Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Centro de Pesquisa em Virologia, Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Roberta Vieira de Morais BronzoniUniversidade Federal de Mato Grosso, Universidade Federal de Mato Grosso, Instituto de Ciências da Saúde, Centro Universitário de Sinop, Sinop MT , Brasil, Universidade Federal de Mato Grosso, Instituto de Ciências da Saúde, Centro Universitário de Sinop, Sinop, MT, Brasil.
Maurício Lacerda NogueiraFaculdade de Medicina de São José do Rio Preto, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, Laboratório de Pesquisa em Virologia, São José do Rio Preto SP , Brasil, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, Laboratório de Pesquisa em Virologia, São José do Rio Preto, SP, Brasil.
Edison Luiz DurigonUniversidade de São Paulo, Universidade de São Paulo, Instituto de Ciências Biomédicas, Laboratório de Virologia Clínica e Molecular, São Paulo SP , Brasil, Universidade de São Paulo, Instituto de Ciências Biomédicas, Laboratório de Virologia Clínica e Molecular, São Paulo, SP, Brasil.
Luiz Tadeu Moraes FigueiredoUniversidade de São Paulo, Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Centro de Pesquisa em Virologia, Ribeirão Preto SP , Brasil, Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Centro de Pesquisa em Virologia, Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo · BRUniversidade Brasil · BRFaculdade de Medicina de São José do Rio Preto · BRUniversidade Federal de Mato Grosso · BR

Funding

No grant is acknowledged in the PubMed record.

6 · The paper itself

Abstract

Vesiculoviruses (VSV) are zoonotic viruses that cause vesicular stomatitis disease in cattle, horses and pigs, as well as sporadic human cases of acute febrile illness. Therefore, diagnosis of VSV infections by reliable laboratory techniques is important to allow a proper case management and implementation of strategies for the containment of virus spread. We show here a sensitive and reproducible real-time reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) for detection and quantification of VSV. The assay was evaluated with arthropods and serum samples obtained from horses, cattle and patients with acute febrile disease. The real-time RT-PCR amplified the Piry, Carajas, Alagoas and Indiana Vesiculovirus at a melting temperature 81.02 ± 0.8ºC, and the sensitivity of assay was estimated in 10 RNA copies/mL to the Piry Vesiculovirus. The viral genome has been detected in samples of horses and cattle, but not detected in human sera or arthropods. Thus, this assay allows a preliminary differential diagnosis of VSV infections.

Indexed as

AnimalsCattleHorsesHumansReal-Time Polymerase Chain ReactionReproducibility of ResultsReverse Transcriptase Polymerase Chain ReactionRNA, ViralSensitivity and SpecificityVesicular StomatitisVesiculovirusRNA, Viral

Identifiers

PMID27276185
PMCPMC4909037
OpenAlexW2410374541

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LicenceCC BY
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Registered trials

None linked

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