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ArticleEuropean journal of human genetics : EJHG2016

The expanding spectrum of COL2A1 gene variants IN 136 patients with a skeletal dysplasia phenotype.

Mouna Barat-Houari, Bruno Dumont, Aurélie Fabre, Frédéric Tm Them, Yves Alembik, Jean-Luc Alessandri, Jeanne Amiel, Séverine Audebert, Clarisse Baumann-Morel, Patricia Blanchet and 45 more

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In one paragraph

Article in European journal of human genetics : EJHG, 2016. The graph could read no effect estimate from its abstract, so it casts no vote on the map. Cited by 37 papers.

0numbers the graph read from it
0cells of the map it votes in
37citing papers in PubMed
2.2field-weighted citation impact, top 11% of its field
1 · What the graph read from it

What it found

Each row is one number read from the abstract, on the scale the paper reported it, with its interval. Left of the dashed line favours the treatment, right favours the comparator. Under each row is the sentence it came from. New to these charts? A ten-minute tutorial.

The abstract states no effect estimate the extractor could read, or names no intervention and outcome on the map, so this paper lights no cell and moves no belief. It is still indexed, cited and linked below.

2 · The registry

The trial behind it

Trials whose registry record cites this paper, or whose number appears in the abstract. A trial that started after this paper was published is citing it as background, not reporting it.

Neither the registry nor the abstract names a trial number. If this is a trial report, that itself is worth knowing.

3 · Its place in the literature

Who cites it

37 citing papers in PubMed, 58 citations in OpenAlex.

  1. Article
  2. Article
  3. Nucleic Acids as Emerging Regulators of Calcium Phosphate Biomineralization.FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology · 2026
    Review
  4. Article
  5. A novel mutation inJCEM case reports · 2026
    Article
  6. Article
  7. Review
  8. Article
  9. Domain specific phenotypic expansion associated with variants inmedRxiv : the preprint server for health sciences · 2025
    Article
  10. Review
  11. Review
  12. Article
  13. Article
  14. Article
  15. Article
  16. Article
  17. Article
  18. Article
  19. Article
  20. Article
4 · The record

Corrections and comments

PubMed lists nothing against this paper. Absence here is not a guarantee, only a check that was made.

5 · Who and what money

Authors and funding

55 authors at 20 institutions in 1 country.

Mouna Barat-HouariLaboratoire de génétique des maladies rares et auto-inflammatoires, CHRU, Montpellier, France.
Bruno DumontLaboratoire de génétique des maladies rares et auto-inflammatoires, CHRU, Montpellier, France.
Aurélie FabreLaboratoire de génétique des maladies rares et auto-inflammatoires, CHRU, Montpellier, France.
Frédéric Tm ThemDépartement de Génétique Médicale, Centre de référence des anomalies du développement, Centre de compétence des Maladies Osseuses Constitutionnelles, CHRU, Montpellier, France.
Yves AlembikGénétique Médicale, Hôpital Hautepierre, Strasbourg, France.
Jean-Luc AlessandriRéanimation pédiatrique, CHU Félix Guyon, Saint-Denis, La Réunion, France.
Jeanne AmielDépartement de Génétique et INSERM U781, Université Paris Descartes-Sorbonne Paris Cité, Fondation Imagine, Hôpital Necker-Enfants malades, AP-HP, Paris, France.
Séverine AudebertPédiatrie et Génétique Médicale, CHU de Brest - Hôpital Auguste Morvan, Brest, France.
Clarisse Baumann-MorelDépartement de Génétique, Hôpital Robert Debré, Paris, France.
Patricia BlanchetDépartement de Génétique Médicale, Centre de référence des anomalies du développement, Centre de compétence des Maladies Osseuses Constitutionnelles, CHRU, Montpellier, France.
Eric BiethDépartement de Génétique Médicale, institut Fédératif de Biologie, Hôpital Purpan, Toulouse, France.
Marie BrechardUnité de consultations externes, Hôpital Saint Joseph, Marseille, France.
Tiffany BusaUnité de Génétique Clinique, Hôpital d'Enfants de la Timone, Marseille, France.
Patrick CalvasDépartement de Génétique Médicale, institut Fédératif de Biologie, Hôpital Purpan, Toulouse, France.
Yline CapriDépartement de Génétique, Hôpital Robert Debré, Paris, France.
François CartaultService de Génétique, CHU Félix Guyon, Saint-Denis, La Réunion, France.
Nicolas ChassaingDépartement de Génétique Médicale, institut Fédératif de Biologie, Hôpital Purpan, Toulouse, France.
Vidrica CiorcaService de Génétique, CHU de Nancy, Nancy, France.
Christine CoubesDépartement de Génétique Médicale, Centre de référence des anomalies du développement, Centre de compétence des Maladies Osseuses Constitutionnelles, CHRU, Montpellier, France.
Albert DavidGénétique Médicale, CHU, Nantes, France.
Anne-Lise DelezoideService de Biologie du Développement, Hôpital Robert Debré, Paris, France.
Delphine Dupin-DeguineDépartement de Génétique Médicale, institut Fédératif de Biologie, Hôpital Purpan, Toulouse, France.
Salima El ChehadehCentre de Génétique, CHU Dijon - Hôpital d'Enfants, Dijon, France.
Laurence FaivreCentre de Génétique, CHU Dijon - Hôpital d'Enfants, Dijon, France.
Fabienne GiulianoDépartement de Génétique Médicale, CHU de Nice - Hôpital de l'Archet II, Nice, France.
Alice GoldenbergUnité de Génétique Clinique, CHU de Rouen - Hôpital Charles Nicolle, Rouen, France.
Bertrand IsidorGénétique Médicale, CHU, Nantes, France.
Marie-Line JacquemontGénétique Médicale, CHU de la Réunion, Saint Pierre, La Réunion, France.
Sophie JuliaDépartement de Génétique Médicale, institut Fédératif de Biologie, Hôpital Purpan, Toulouse, France.
Josseline KaplanDépartement de Génétique et INSERM U781, Université Paris Descartes-Sorbonne Paris Cité, Fondation Imagine, Hôpital Necker-Enfants malades, AP-HP, Paris, France.
Didier LacombeDépartement de Génétique Médicale, Groupe Hospitalier Pellegrin, Bordeaux, France.
Marine LebrunGénétique Clinique, Chromosomique et Moléculaire, CHU Hôpital Nord, St Pirest en Jarez, France.
Sandrine MarlinGénétique et Embryologie Médicales, Hôpital Armand Trousseau, Paris, France.
Dominique Martin-CoignardGénétique Médicale et Cytogénétique, Centre Hospitalier Le Mans, Le Mans, France.
Jelena MartinovicUnité de Fœtopathologie, Hôpital Antoine Béclère, Paris, France.
Alice MasurelCentre de Génétique, CHU Dijon - Hôpital d'Enfants, Dijon, France.
Judith MelkiPôle Neurosciences Tête et Cou (NTC), GHU Paris-Sud - Hôpital de Bicêtre, Le Kremlin Bicêtre, France.
Monique Mozelle-NivoixUnité de génétique - Cytogénétique CHU de Troyes, Troyes, France.
Karine NguyenUnité de Génétique Clinique, Hôpital d'Enfants de la Timone, Marseille, France.
Sylvie OdentService de Génétique Clinique, numéro 9, CHU, Rennes, France.
Nicole PhilipUnité de Génétique Clinique, Hôpital d'Enfants de la Timone, Marseille, France.
Lucile PinsonDépartement de Génétique Médicale, Centre de référence des anomalies du développement, Centre de compétence des Maladies Osseuses Constitutionnelles, CHRU, Montpellier, France.
Ghislaine PlessisGénétique Médicale, CHU Caen - Hôpital Clémenceau, Caen, France.
Chloé QuélinService de Génétique Clinique, numéro 9, CHU, Rennes, France.
Elise ShaefferGénétique Médicale, Hôpital Hautepierre, Strasbourg, France.
Sabine SigaudyUnité de Génétique Clinique, Hôpital d'Enfants de la Timone, Marseille, France.
Christel ThauvinCentre de Génétique, CHU Dijon - Hôpital d'Enfants, Dijon, France.
Marianne TillService de Cytogénétique Constitutionnelle, Groupement Hospitalier Est - Hôpitaux de Lyon, Bron, France.
Renaud TouraineGénétique Clinique, Chromosomique et Moléculaire, CHU Hôpital Nord, St Pirest en Jarez, France.
Jacqueline VigneronGénétique clinique Néonatalogie, Maternité Régionale, Nancy, France.
Geneviève BaujatDépartement de Génétique et INSERM U781, Université Paris Descartes-Sorbonne Paris Cité, Fondation Imagine, Hôpital Necker-Enfants malades, AP-HP, Paris, France.
Valérie Cormier-DaireDépartement de Génétique et INSERM U781, Université Paris Descartes-Sorbonne Paris Cité, Fondation Imagine, Hôpital Necker-Enfants malades, AP-HP, Paris, France.
Martine Le MerrerDépartement de Génétique et INSERM U781, Université Paris Descartes-Sorbonne Paris Cité, Fondation Imagine, Hôpital Necker-Enfants malades, AP-HP, Paris, France.
David GenevièveDépartement de Génétique Médicale, Centre de référence des anomalies du développement, Centre de compétence des Maladies Osseuses Constitutionnelles, CHRU, Montpellier, France.
Isabelle TouitouLaboratoire de génétique des maladies rares et auto-inflammatoires, CHRU, Montpellier, France.
Hôpital d'Enfants · FRHôpital Purpan · FRInserm · FRHôpital de la Timone · FRHôpital Robert-Debré · FRSorbonne Paris Cité · FRCentre Hospitalier Universitaire de La Réunion · FRGénétique Médicale & Génomique Fonctionelle · FRHôpital d'Hautepierre · FRHôpital Nord · FRBicêtre Hospital · FRCentre Hospitalier du Mans · FRCentre Hospitalier Régional et Universitaire de Nancy · FRCentre Hospitalier Régional Universitaire de Brest · FRCentre Hospitalier Universitaire de Nice · FRCentre Hospitalier Universitaire de Rennes · FRHôpital Antoine-Béclère · FRHôpital Pellegrin · FRHôpital Saint Joseph · FRLaboratoire de Génétique Cellulaire · FR

Funding

No grant is acknowledged in the PubMed record.

6 · The paper itself

Abstract

Heterozygous COL2A1 variants cause a wide spectrum of skeletal dysplasia termed type II collagenopathies. We assessed the impact of this gene in our French series. A decision tree was applied to select 136 probands (71 Stickler cases, 21 Spondyloepiphyseal dysplasia congenita cases, 11 Kniest dysplasia cases, and 34 other dysplasia cases) before molecular diagnosis by Sanger sequencing. We identified 66 different variants among the 71 positive patients. Among those patients, 18 belonged to multiplex families and 53 were sporadic. Most variants (38/44, 86%) were located in the triple helical domain of the collagen chain and glycine substitutions were mainly observed in severe phenotypes, whereas arginine to cysteine changes were more often encountered in moderate phenotypes. This series of skeletal dysplasia is one of the largest reported so far, adding 44 novel variants (15%) to published data. We have confirmed that about half of our Stickler patients (46%) carried a COL2A1 variant, and that the molecular spectrum was different across the phenotypes. To further address the question of genotype-phenotype correlation, we plan to screen our patients for other candidate genes using a targeted next-generation sequencing approach.

Indexed as

Amino Acid SubstitutionPhenotypeArthritisCollagen DiseasesCollagen Type IIConnective Tissue DiseasesFemaleHearing Loss, SensorineuralHumansMaleOsteochondrodysplasiasPedigreeProtein DomainsRetinal DetachmentCOL2A1 protein, humanCollagen Type II

Identifiers

PMID26626311
PMCPMC5070901
OpenAlexW2396857156

What OpenQuestion holds

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