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Trial reportBioMed research international2014

Prevalence of gene rearrangements in Mexican children with acute lymphoblastic leukemia: a population study-report from the Mexican Interinstitutional Group for the identification of the causes of childhood leukemia.

Vilma Carolina Bekker-Méndez, Enrique Miranda-Peralta, Juan Carlos Núñez-Enríquez, Irma Olarte-Carrillo, Francisco Xavier Guerra-Castillo, Ericka Nelly Pompa-Mera, Alicia Ocaña-Mondragón, Angélica Rangel-López, Roberto Bernáldez-Ríos, Aurora Medina-Sanson and 15 more

Open access · hybridAbstract readClinical TrialMulticenter Study
In one paragraph

Trial report in BioMed research international, 2014. The graph could read no effect estimate from its abstract, so it casts no vote on the map. Cited by 20 papers, 1 of them a synthesis that pooled it.

0numbers the graph read from it
0cells of the map it votes in
20citing papers in PubMed, 1 pooled it
4.2field-weighted citation impact, top 6% of its field
1 · What the graph read from it

What it found

Each row is one number read from the abstract, on the scale the paper reported it, with its interval. Left of the dashed line favours the treatment, right favours the comparator. Under each row is the sentence it came from. New to these charts? A ten-minute tutorial.

The abstract states no effect estimate the extractor could read, or names no intervention and outcome on the map, so this paper lights no cell and moves no belief. It is still indexed, cited and linked below.

2 · The registry

The trial behind it

Trials whose registry record cites this paper, or whose number appears in the abstract. A trial that started after this paper was published is citing it as background, not reporting it.

Neither the registry nor the abstract names a trial number. If this is a trial report, that itself is worth knowing.

3 · Its place in the literature

Who cites it

20 citing papers in PubMed, 1 synthesis or guideline pooled it, 41 citations in OpenAlex.

  1. Pooled it
  2. Article
  3. Article
  4. Article
  5. Article
  6. Article
  7. Article
  8. Article
  9. Article
  10. Low Prevalence ofFrontiers in pediatrics · 2022
    Article
  11. Underexpression ofFrontiers in oncology · 2022
    Article
  12. Article
  13. Review
  14. Review
  15. Article
  16. Article
  17. Article
  18. Article
  19. Article
  20. Article
4 · The record

Corrections and comments

PubMed lists nothing against this paper. Absence here is not a guarantee, only a check that was made.

5 · Who and what money

Authors and funding

25 authors at 4 institutions in 1 country.

Vilma Carolina Bekker-MéndezUnidad de Investigación Médica en Inmunología e Infectología, Hospital de Infectología "Dr. Daniel Méndez Hernández", "La Raza", Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Avenida Jacarandas Esquina Vallejo S/N colonia La Raza, 02990 México, DF, Mexico.
Enrique Miranda-PeraltaLaboratorio de Biología Molecular, Hospital General de México, Secretaria de Salud (SS), Eje 2A Sur (Dr. Balmis) 148, Col. Doctores, Delegación Cuauhtémoc, 06726 México, DF, Mexico.
Juan Carlos Núñez-EnríquezUnidad de Investigación Médica en Epidemiología Clínica, Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional (CMN) "Siglo XXI", Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Avenida Cuauhtémoc 330, Delegación Cuauhtémoc, 06720 México, DF, Mexico.
Irma Olarte-CarrilloLaboratorio de Biología Molecular, Hospital General de México, Secretaria de Salud (SS), Eje 2A Sur (Dr. Balmis) 148, Col. Doctores, Delegación Cuauhtémoc, 06726 México, DF, Mexico.
Francisco Xavier Guerra-CastilloUnidad de Investigación Médica en Inmunología e Infectología, Hospital de Infectología "Dr. Daniel Méndez Hernández", "La Raza", Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Avenida Jacarandas Esquina Vallejo S/N colonia La Raza, 02990 México, DF, Mexico.
Ericka Nelly Pompa-MeraUnidad de Investigación Médica en Inmunología e Infectología, Hospital de Infectología "Dr. Daniel Méndez Hernández", "La Raza", Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Avenida Jacarandas Esquina Vallejo S/N colonia La Raza, 02990 México, DF, Mexico.
Alicia Ocaña-MondragónUnidad de Investigación Médica en Inmunología e Infectología, Hospital de Infectología "Dr. Daniel Méndez Hernández", "La Raza", Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Avenida Jacarandas Esquina Vallejo S/N colonia La Raza, 02990 México, DF, Mexico.
Angélica Rangel-LópezUnidad de Investigación Médica en Epidemiología Clínica, Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional (CMN) "Siglo XXI", Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Avenida Cuauhtémoc 330, Delegación Cuauhtémoc, 06720 México, DF, Mexico.ORCID 0000-0001-7040-9379
Roberto Bernáldez-RíosServicio de Hematología, UMAE Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional (CMN) "Siglo XXI", Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Avenida Cuauhtémoc 330, Delegación Cuauhtémoc, 06720 México, DF, Mexico.
Aurora Medina-SansonDepartamento de Hemato-Oncología, Hospital Infantil de México Federico Gómez, Secretaria de Salud (SS), Calle Doctor Márquez 162, Colonia Doctores, Delegación Cuauhtémoc, 06720 México, DF, Mexico.
Elva Jiménez-HernándezServicio de Hematología Pediátrica, Hospital General "Gaudencio González Garza", Centro Médico Nacional (CMN) "La Raza", Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Calzada Vallejo y Jacarandas S/N Colonia La Raza, Delegación Azcapotzalco, 02990 México, DF, Mexico.
Raquel Amador-SánchezServicio de Hematología Pediátrica, Hospital General Regional "Carlos McGregor Sánchez Navarro", Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Avenida Gabriel Mancera No. 222, Colonia Del Valle, 03100 México, DF, Mexico.
José Gabriel Peñaloza-GonzálezServicio de Onco-Pediatría, Hospital Juárez de México, Secretaria de Salud (SS), Avenida Instituto Politécnico Nacional 5160, Colonia Magdalena de las Salinas, Delegación Gustavo A. Madero, 07760 México, DF, Mexico.
José de Diego Flores-ChapaServicio de Hematología Pediátrica, CMN "20 de Noviembre", Instituto de Seguridad Social al Servicio de los Trabajadores del Estado (ISSSTE), Félix Cuevas 540, Colonia Del Valle, Delegación Benito Juárez, 03229 México, DF, Mexico.
Arturo Fajardo-GutiérrezUnidad de Investigación Médica en Epidemiología Clínica, Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional (CMN) "Siglo XXI", Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Avenida Cuauhtémoc 330, Delegación Cuauhtémoc, 06720 México, DF, Mexico.
Janet Flores-LujanoUnidad de Investigación Médica en Epidemiología Clínica, Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional (CMN) "Siglo XXI", Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Avenida Cuauhtémoc 330, Delegación Cuauhtémoc, 06720 México, DF, Mexico.
María Del Carmen Rodríguez-ZepedaServicio de Hematología, UMAE Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional (CMN) "Siglo XXI", Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Avenida Cuauhtémoc 330, Delegación Cuauhtémoc, 06720 México, DF, Mexico.
Elisa María Dorantes-AcostaDepartamento de Hemato-Oncología, Hospital Infantil de México Federico Gómez, Secretaria de Salud (SS), Calle Doctor Márquez 162, Colonia Doctores, Delegación Cuauhtémoc, 06720 México, DF, Mexico.
Victoria Bolea-MurgaServicio de Hematología Pediátrica, Hospital General de México, Secretaria de Salud (SS), Eje 2A Sur (Dr. Balmis) 148, Col. Doctores, Delegación Cuauhtémoc, 06726 México, DF, Mexico.
Nancy Núñez-VillegasServicio de Hematología Pediátrica, Hospital General "Gaudencio González Garza", Centro Médico Nacional (CMN) "La Raza", Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Calzada Vallejo y Jacarandas S/N Colonia La Raza, Delegación Azcapotzalco, 02990 México, DF, Mexico.
Martha Margarita Velázquez-AviñaServicio de Onco-Pediatría, Hospital Juárez de México, Secretaria de Salud (SS), Avenida Instituto Politécnico Nacional 5160, Colonia Magdalena de las Salinas, Delegación Gustavo A. Madero, 07760 México, DF, Mexico.
José Refugio Torres-NavaServicio de Oncología Pediátrica, Hospital Pediátrico de Moctezuma, Secretaria de Salud del DF (SSDF), Oriente 158-189, Colonia Moctezuma 2a Sección, Delegación Venustiano Carranza, 15530 México, DF, Mexico.
Nancy Carolina Reyes-ZepedaServicio de Hematología Pediátrica, CMN "20 de Noviembre", Instituto de Seguridad Social al Servicio de los Trabajadores del Estado (ISSSTE), Félix Cuevas 540, Colonia Del Valle, Delegación Benito Juárez, 03229 México, DF, Mexico.
Cesar González-BonillaLaboratorio de la Coordinación de Vigilancia Epidemiológica y Apoyo en Contingencias, Unidad de Investigación Médica en Inmunología e Infectología, Hospital de Infectología "Dr. Daniel Méndez Hernández", "La Raza", Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Calzada Vallejo y Jacarandas S/N Colonia La Raza, Delegación Azcapotzalco, 02990 México, DF, Mexico.
Juan Manuel Mejía-AranguréUnidad de Investigación Médica en Epidemiología Clínica, Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional (CMN) "Siglo XXI", Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Avenida Cuauhtémoc 330, Delegación Cuauhtémoc, 06720 México, DF, Mexico ; Coordinación de Investigación en Salud, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Avenida Cuauhtémoc 330, 4to Piso Edificio de la Academia Nacional de Medicina, 06720 México, DF, Mexico.
Mexican Social Security Institute · MXSecretaria de Salud · MXHospital General de México · MXInstitute for Social Security and Services for State Workers · MX

Funding

No grant is acknowledged in the PubMed record.

6 · The paper itself

Abstract

Mexico has one of the highest incidences of childhood leukemia worldwide and significantly higher mortality rates for this disease compared with other countries. One possible cause is the high prevalence of gene rearrangements associated with the etiology or with a poor prognosis of childhood acute lymphoblastic leukemia (ALL). The aims of this multicenter study were to determine the prevalence of the four most common gene rearrangements [ETV6-RUNX1, TCF3-PBX1, BCR-ABL1, and MLL rearrangements] and to explore their relationship with mortality rates during the first year of treatment in ALL children from Mexico City. Patients were recruited from eight public hospitals during 2010-2012. A total of 282 bone marrow samples were obtained at each child's diagnosis for screening by conventional and multiplex reverse transcription polymerase chain reaction to determine the gene rearrangements. Gene rearrangements were detected in 50 (17.7%) patients. ETV6-RUNX1 was detected in 21 (7.4%) patients, TCF3-PBX1 in 20 (7.1%) patients, BCR-ABL1 in 5 (1.8%) patients, and MLL rearrangements in 4 (1.4%) patients. The earliest deaths occurred at months 1, 2, and 3 after diagnosis in patients with MLL, ETV6-RUNX1, and BCR-ABL1 gene rearrangements, respectively. Gene rearrangements could be related to the aggressiveness of leukemia observed in Mexican children.

Indexed as

Gene RearrangementAdolescentChildChild, PreschoolDisease-Free SurvivalHL-60 CellsHumansMexicoOncogene Proteins, FusionPrecursor Cell Lymphoblastic Leukemia-LymphomaPrevalenceSurvival RateOncogene Proteins, Fusion

Identifiers

PMID25692130
PMCPMC4323064
OpenAlexW2016293493

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